More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1356 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1356  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 416 aa  867    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0821973  hitchhiker  0.0000000382903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  68.93 
 
 		 415 aa  599  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1833  serine hydroxymethyltransferase  68.01 
 
 		 423 aa  598  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.785323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0023  serine hydroxymethyltransferase  68.04 
 
 		 436 aa  580  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2187  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 417 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.911574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  59.55 
 
 		 410 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 414 aa  506  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 410 aa  501  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  57.39 
 
 		 416 aa  498  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 420 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 414 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 422 aa  490  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 		 413 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 		 413 aa  484  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 412 aa  479  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  56.33 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 411 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 412 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0451  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178848  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 422 aa  478  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  56.27 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  56.02 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0425  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 414 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0460217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 426 aa  475  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  54.42 
 
 		 435 aa  476  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1555  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 414 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  56.4 
 
 		 415 aa  471  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  52.82 
 
 		 436 aa  471  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 418 aa  472  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  54.24 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  54 
 
 		 413 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  57.96 
 
 		 418 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1647  serine hydroxymethyltransferase  57.42 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 411 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  55.01 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  53.51 
 
 		 413 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  53.75 
 
 		 413 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 412 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 		 420 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 414 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0489  serine hydroxymethyltransferase  56.05 
 
 		 413 aa  463  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 415 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 414 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  53.51 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  51.88 
 
 		 436 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 419 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 414 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1141  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 414 aa  464  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.217478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7293  Glycine hydroxymethyltransferase  54.03 
 
 		 425 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 413 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  52.3 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  54.77 
 
 		 416 aa  458  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1660  serine hydroxymethyltransferase  55.33 
 
 		 414 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  53.92 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  54.15 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  53.3 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0915  Glycine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2044  serine hydroxymethyltransferase  55.33 
 
 		 414 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110649  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>