More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0425 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1350  serine hydroxymethyltransferase  79.23 
 
 		 414 aa  690    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178736  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0451  serine hydroxymethyltransferase  98.31 
 
 		 414 aa  847    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178848  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1555  serine hydroxymethyltransferase  97.83 
 
 		 414 aa  844    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0489  serine hydroxymethyltransferase  86.65 
 
 		 413 aa  748    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0575  Glycine hydroxymethyltransferase  75.73 
 
 		 415 aa  661    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00199338  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0226  serine hydroxymethyltransferase  79.23 
 
 		 414 aa  691    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.667379  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1141  serine hydroxymethyltransferase  80.19 
 
 		 414 aa  703    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.217478  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1647  serine hydroxymethyltransferase  77.97 
 
 		 415 aa  679    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0425  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 414 aa  855    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0460217  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1274  serine hydroxymethyltransferase  72.82 
 
 		 415 aa  619  1e-176  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020051  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1947  serine hydroxymethyltransferase  68.52 
 
 		 420 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 417 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 417 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 417 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 417 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 417 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.79 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 420 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0577  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 419 aa  494  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 413 aa  498  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 422 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1580  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540119  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  56.62 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 417 aa  484  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  54.26 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 416 aa  484  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 419 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  57.74 
 
 		 414 aa  484  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  54.26 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 410 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  54.26 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 433 aa  481  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 417 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 		 412 aa  481  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  58.58 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  58.68 
 
 		 410 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 		 412 aa  481  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 427 aa  478  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 413 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  54.05 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.09 
 
 		 415 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 427 aa  480  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  55.67 
 
 		 417 aa  478  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  55.42 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  59.16 
 
 		 416 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  53.4 
 
 		 418 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  56.39 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 415 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 		 419 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  59.16 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  57.53 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1380  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105108  hitchhiker  0.000029211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  54.7 
 
 		 437 aa  471  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>