More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0575 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0451  serine hydroxymethyltransferase  76.21 
 
 		 414 aa  665    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178848  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1141  serine hydroxymethyltransferase  78.64 
 
 		 414 aa  690    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.217478  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1555  serine hydroxymethyltransferase  75.97 
 
 		 414 aa  665    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0425  serine hydroxymethyltransferase  75.73 
 
 		 414 aa  661    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0460217  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1274  serine hydroxymethyltransferase  76.39 
 
 		 415 aa  647    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020051  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0489  serine hydroxymethyltransferase  75.3 
 
 		 413 aa  659    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1647  serine hydroxymethyltransferase  75.42 
 
 		 415 aa  674    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1350  serine hydroxymethyltransferase  77.43 
 
 		 414 aa  683    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178736  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0226  serine hydroxymethyltransferase  77.18 
 
 		 414 aa  681    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.667379  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0575  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 415 aa  858    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00199338  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1947  serine hydroxymethyltransferase  75.73 
 
 		 420 aa  629  1e-179  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 		 434 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 		 434 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 434 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  58.52 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  59.65 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 		 417 aa  498  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 419 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.52 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 420 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  58.52 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 415 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 		 422 aa  492  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 		 431 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 		 416 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 412 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  56.15 
 
 		 435 aa  489  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 424 aa  486  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  60.51 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  57.69 
 
 		 432 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  58.21 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  60.76 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 425 aa  487  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  57.78 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  61.01 
 
 		 417 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 427 aa  484  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  62.63 
 
 		 422 aa  482  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  56.91 
 
 		 436 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  60.76 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  57.88 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 415 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 431 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0577  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  58.02 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  59.6 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>