More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0489 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1647  serine hydroxymethyltransferase  77.91 
 
 		 415 aa  681    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0451  serine hydroxymethyltransferase  86.17 
 
 		 414 aa  746    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0575  Glycine hydroxymethyltransferase  75.3 
 
 		 415 aa  659    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00199338  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0489  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 413 aa  852    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0425  serine hydroxymethyltransferase  86.65 
 
 		 414 aa  748    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0460217  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0226  serine hydroxymethyltransferase  78.16 
 
 		 414 aa  677    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.667379  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1555  serine hydroxymethyltransferase  86.17 
 
 		 414 aa  746    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1350  serine hydroxymethyltransferase  77.91 
 
 		 414 aa  676    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178736  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1141  serine hydroxymethyltransferase  79.37 
 
 		 414 aa  692    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.217478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1274  serine hydroxymethyltransferase  72.64 
 
 		 415 aa  617  1e-175  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020051  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1947  serine hydroxymethyltransferase  67.72 
 
 		 420 aa  570  1e-161  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  58.58 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  58.09 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  58.58 
 
 		 417 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  58.09 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0577  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 419 aa  495  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 417 aa  498  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 419 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 422 aa  495  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  58.68 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  58.58 
 
 		 412 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 422 aa  493  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1580  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 412 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  55.26 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  58.01 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  60.94 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 		 420 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 414 aa  491  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 		 413 aa  488  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 413 aa  488  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  54.77 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 415 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 410 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 417 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 		 425 aa  481  1e-135  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 		 414 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 431 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 		 434 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 414 aa  482  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 423 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 410 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  59.65 
 
 		 412 aa  481  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  56.56 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  54.66 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  56.17 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  59.65 
 
 		 412 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 436 aa  481  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  59.07 
 
 		 413 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>