More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1947 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0226  serine hydroxymethyltransferase  73.61 
 
 		 414 aa  641    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.667379  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1141  serine hydroxymethyltransferase  73.12 
 
 		 414 aa  638    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.217478  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1350  serine hydroxymethyltransferase  72.4 
 
 		 414 aa  634    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178736  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1274  serine hydroxymethyltransferase  82.86 
 
 		 415 aa  696    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020051  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1947  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 420 aa  866    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0575  Glycine hydroxymethyltransferase  75.73 
 
 		 415 aa  651    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00199338  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1647  serine hydroxymethyltransferase  70.22 
 
 		 415 aa  622  1e-177  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1555  serine hydroxymethyltransferase  68.77 
 
 		 414 aa  598  1e-170  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0451  serine hydroxymethyltransferase  68.77 
 
 		 414 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178848  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0425  serine hydroxymethyltransferase  68.52 
 
 		 414 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0460217  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0489  serine hydroxymethyltransferase  67.72 
 
 		 413 aa  591  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 417 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  59.62 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 417 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  59.43 
 
 		 422 aa  508  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  60.25 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  59.65 
 
 		 417 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 417 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  59.65 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  58.52 
 
 		 417 aa  504  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 417 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  58.52 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  59.65 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 419 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 416 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.52 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  59.16 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 		 413 aa  501  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  57.78 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  57.31 
 
 		 436 aa  492  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 418 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  56.32 
 
 		 421 aa  490  1e-137  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 416 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 412 aa  484  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  56.56 
 
 		 437 aa  487  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2755  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.418331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004230  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 		 416 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000024605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1380  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105108  hitchhiker  0.000029211 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  59.7 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2796  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  59.54 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2710  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2930  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 		 435 aa  482  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2817  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33010  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 418 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.821039  hitchhiker  0.000096337 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01208  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 		 416 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1117  Glycine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2704  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 		 425 aa  479  1e-134  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  57.45 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 427 aa  478  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 418 aa  479  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0577  serine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  61.98 
 
 		 412 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2836  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  58.21 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02987  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 418 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00150285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>