More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1647 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0226  serine hydroxymethyltransferase  84.5 
 
 		 414 aa  733    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.667379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0451  serine hydroxymethyltransferase  77.48 
 
 		 414 aa  676    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178848  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0489  serine hydroxymethyltransferase  77.91 
 
 		 413 aa  681    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1350  serine hydroxymethyltransferase  83.29 
 
 		 414 aa  722    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178736  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1274  serine hydroxymethyltransferase  74.22 
 
 		 415 aa  640    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0425  serine hydroxymethyltransferase  77.97 
 
 		 414 aa  679    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0460217  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0575  Glycine hydroxymethyltransferase  75.42 
 
 		 415 aa  674    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00199338  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1555  serine hydroxymethyltransferase  77.48 
 
 		 414 aa  676    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1647  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 415 aa  860    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1141  serine hydroxymethyltransferase  83.78 
 
 		 414 aa  733    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.217478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1947  serine hydroxymethyltransferase  70.22 
 
 		 420 aa  600  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  57.42 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 419 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 414 aa  489  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 417 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 417 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 417 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 417 aa  484  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  54.15 
 
 		 417 aa  484  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 415 aa  481  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 415 aa  481  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 417 aa  481  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  53.9 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  55.26 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  54.77 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  55.26 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0915  Glycine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 427 aa  482  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  56.14 
 
 		 431 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 432 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 412 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 		 431 aa  478  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  57.87 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 420 aa  478  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  54.57 
 
 		 422 aa  478  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 425 aa  478  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 433 aa  475  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  54.28 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  55.66 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 417 aa  474  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3410  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  58.15 
 
 		 412 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 432 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 417 aa  478  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0577  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  53.17 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  56.25 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1580  serine hydroxymethyltransferase  54.26 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540119  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  55.1 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  53.9 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  55.18 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  54.37 
 
 		 423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  55.18 
 
 		 431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 		 432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  55.16 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2991  serine hydroxymethyltransferase  55.42 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406931  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  55.29 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  54.94 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 410 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>