More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2242 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 420 aa  855    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2509  serine hydroxymethyltransferase  72.33 
 
 		 420 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1537  serine hydroxymethyltransferase  77.64 
 
 		 427 aa  664    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.54072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6691  Glycine hydroxymethyltransferase  84.38 
 
 		 418 aa  723    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476522  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0624  serine hydroxymethyltransferase  72.22 
 
 		 420 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.260999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0231  Glycine hydroxymethyltransferase  72.82 
 
 		 423 aa  610  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.681161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1644  serine hydroxymethyltransferase  70.83 
 
 		 420 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  68.52 
 
 		 417 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 412 aa  485  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 415 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  59.52 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.73 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 		 431 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 420 aa  478  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 415 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  58.21 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  54.95 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 432 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 		 437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 410 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 411 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  55.02 
 
 		 425 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  57.31 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 432 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  55.02 
 
 		 425 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 431 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 410 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 434 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 415 aa  463  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 438 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000232  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  57.45 
 
 		 432 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 436 aa  461  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 		 440 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 		 419 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  56.17 
 
 		 421 aa  459  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 		 413 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 429 aa  460  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 429 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  55.18 
 
 		 438 aa  458  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  53.4 
 
 		 417 aa  454  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  59.79 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  54.81 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  56.3 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 416 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 432 aa  458  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  54.37 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  53.6 
 
 		 436 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  54.29 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05971  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 431 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  54.37 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  51.82 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  55.16 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  54.81 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  53.55 
 
 		 412 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0218  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0240245  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0311  serine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33010  serine hydroxymethyltransferase  54.61 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.821039  hitchhiker  0.000096337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  54.57 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2807  serine hydroxymethyltransferase  54.13 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0316342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  54.57 
 
 		 417 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  53.68 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  52.67 
 
 		 423 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  54.33 
 
 		 416 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  55.07 
 
 		 422 aa  448  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>