More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0231 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0231  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 423 aa  867    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.681161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2509  serine hydroxymethyltransferase  75.12 
 
 		 420 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1537  serine hydroxymethyltransferase  71.23 
 
 		 427 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.54072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6691  Glycine hydroxymethyltransferase  73.38 
 
 		 418 aa  628  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476522  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0624  serine hydroxymethyltransferase  72.26 
 
 		 420 aa  628  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.260999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  72.82 
 
 		 420 aa  625  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1644  serine hydroxymethyltransferase  71.36 
 
 		 420 aa  618  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  67.63 
 
 		 417 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  54.37 
 
 		 416 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 412 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 411 aa  458  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  53.04 
 
 		 412 aa  461  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  54.95 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  54.31 
 
 		 419 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  55.15 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 412 aa  455  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  54.43 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  54.66 
 
 		 410 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  53.04 
 
 		 414 aa  450  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  52.3 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 413 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 		 417 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 423 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  53.59 
 
 		 420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  53.9 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  52.31 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  51.81 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  54.9 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  51.45 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  52.39 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 427 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  52.39 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 417 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  52.06 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 414 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  54.43 
 
 		 413 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  52.43 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  54.26 
 
 		 411 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  51.57 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  52.43 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  54.14 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.59 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  53.04 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  50.24 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  52.26 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  53.55 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  52.31 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  52.87 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  52.53 
 
 		 438 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  52.49 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  54.96 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  52.73 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  51.46 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  52.91 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  52.96 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  53.19 
 
 		 416 aa  433  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  52.67 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  53.2 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  49.29 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  52.18 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  52.67 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 431 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3717  serine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 418 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  50.23 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  54 
 
 		 433 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  56.44 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  53.63 
 
 		 417 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  54 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  52.54 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  52.26 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  56.38 
 
 		 439 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  51.23 
 
 		 411 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  51.32 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  51.46 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  50.97 
 
 		 412 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  53.45 
 
 		 417 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  51.81 
 
 		 416 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  51.23 
 
 		 411 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  52.08 
 
 		 416 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  50.73 
 
 		 427 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>