More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5022 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  90.57 
 
 		 424 aa  798    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  91.27 
 
 		 424 aa  811    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  92.92 
 
 		 424 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  75.71 
 
 		 431 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  92.69 
 
 		 424 aa  806    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  98.58 
 
 		 424 aa  859    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  90.33 
 
 		 424 aa  794    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  92.92 
 
 		 424 aa  806    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  92.92 
 
 		 424 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  98.11 
 
 		 424 aa  852    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 424 aa  867    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  93.4 
 
 		 424 aa  811    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  97.64 
 
 		 424 aa  846    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  92.69 
 
 		 424 aa  806    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  88.44 
 
 		 424 aa  777    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  88.44 
 
 		 424 aa  772    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  92.69 
 
 		 424 aa  806    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  92.45 
 
 		 424 aa  805    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  98.35 
 
 		 424 aa  857    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  98.58 
 
 		 424 aa  859    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  99.06 
 
 		 424 aa  861    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5759  glycine hydroxymethyltransferase  70.05 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0952  serine hydroxymethyltransferase  71.53 
 
 		 435 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000232  serine hydroxymethyltransferase  71.77 
 
 		 431 aa  604  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05971  serine hydroxymethyltransferase  70.81 
 
 		 431 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3844  serine hydroxymethyltransferase  69.52 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.988817  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  68.74 
 
 		 431 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  68.02 
 
 		 431 aa  591  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  68.97 
 
 		 431 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  66.82 
 
 		 437 aa  589  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  67.54 
 
 		 435 aa  590  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  67.78 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  68.18 
 
 		 430 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2283  glycine hydroxymethyltransferase  68.16 
 
 		 425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  66.82 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  67.46 
 
 		 438 aa  581  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  67.22 
 
 		 432 aa  580  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0791  serine hydroxymethyltransferase  69.69 
 
 		 435 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0375384  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  64.62 
 
 		 434 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  64.62 
 
 		 434 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  67.06 
 
 		 433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  67.3 
 
 		 431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  65.63 
 
 		 434 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  64.94 
 
 		 438 aa  570  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 		 433 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  65.63 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  65.24 
 
 		 439 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2991  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 439 aa  565  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406931  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  65.87 
 
 		 440 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1131  serine hydroxymethyltransferase  67.45 
 
 		 438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 		 429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  65.43 
 
 		 432 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  64.47 
 
 		 438 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  66.82 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  63.85 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  67.24 
 
 		 424 aa  557  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 		 420 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  64.45 
 
 		 434 aa  554  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  63.29 
 
 		 432 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  65.09 
 
 		 434 aa  551  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  65.09 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0870  glycine hydroxymethyltransferase  67.95 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  64.86 
 
 		 434 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  64.68 
 
 		 433 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  64.01 
 
 		 422 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 432 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  66.35 
 
 		 451 aa  542  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3047  serine hydroxymethyltransferase  66.27 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302237  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4270  serine hydroxymethyltransferase  68.03 
 
 		 423 aa  544  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978969  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  66.82 
 
 		 433 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  66.82 
 
 		 433 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  65.65 
 
 		 432 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  62.05 
 
 		 436 aa  534  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 		 425 aa  531  1e-149  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 421 aa  521  1e-147  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  60.43 
 
 		 432 aa  518  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  63.11 
 
 		 434 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  61.02 
 
 		 419 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  61.02 
 
 		 427 aa  511  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0311  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 420 aa  506  9.999999999999999e-143  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 431 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  62.91 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 411 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 412 aa  496  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  62.75 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  57.76 
 
 		 412 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 419 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  59.23 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 		 425 aa  490  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  55.66 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 		 413 aa  488  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>