More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4370 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  285  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  57.94 
 
 		 129 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  57.94 
 
 		 129 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  57.98 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 134 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  48.46 
 
 		 134 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  50.42 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0972  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  45.9 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  45.13 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0268  cell division protein FtsY  41.07 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  38.74 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  36.13 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  36.36 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  34.4 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  32.14 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  33.64 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  27.42 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  40.18 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  32.79 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  29.09 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  31.25 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2433  Endoribonuclease L-PSP  37.36 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000552241  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  34.11 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  31.15 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  31.25 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  26.96 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  34.23 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  31.86 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  31.86 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  30.63 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5320  endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  27.64 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1123  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836096 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1512  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>