More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1592 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0359  peptide chain release factor 3  67.5 
 
 		 542 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1338  peptide chain release factor 3  64.57 
 
 		 528 aa  704    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1492  peptide chain release factor 3  62.26 
 
 		 569 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.473522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1529  peptide chain release factor 3  60.3 
 
 		 540 aa  655    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.816656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5464  peptide chain release factor 3  63.79 
 
 		 540 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.934757  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4411  peptide chain release factor 3  65.52 
 
 		 541 aa  709    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1494  peptide chain release factor 3  62.26 
 
 		 545 aa  661    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0346  peptide chain release factor 3  60.81 
 
 		 537 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1592  peptide chain release factor 3  100 
 
 		 527 aa  1070    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06080  peptide chain release factor 3  63.15 
 
 		 544 aa  668    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38845  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0191  peptide chain release factor 3  61.55 
 
 		 535 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3212  peptide chain release factor 3  60.64 
 
 		 538 aa  655    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1328  peptide chain release factor 3  62.86 
 
 		 556 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.693943  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2802  peptide chain release factor 3  62.38 
 
 		 521 aa  635    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1516  peptide chain release factor 3  62.26 
 
 		 545 aa  661    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4207  peptide chain release factor 3  55.75 
 
 		 544 aa  589  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0348722 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0079  small GTP-binding protein  57.17 
 
 		 523 aa  587  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125969  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5645  peptide chain release factor 3  55.41 
 
 		 538 aa  545  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07201  peptide chain release factor 3  46.76 
 
 		 555 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.577625  normal  0.0107792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0780  peptide chain release factor 3  47.89 
 
 		 543 aa  480  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.474397  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0095  peptide chain release factor 3  46.76 
 
 		 555 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1279  peptide chain release factor 3  48.26 
 
 		 548 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07731  peptide chain release factor 3  46.77 
 
 		 555 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107568 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2365  peptide chain release factor 3  48.37 
 
 		 556 aa  478  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.100255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07361  peptide chain release factor 3  46.4 
 
 		 545 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.301095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1056  peptide chain release factor 3  47.08 
 
 		 542 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2904  peptide chain release factor 3  46.01 
 
 		 542 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835611  normal  0.0349958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4549  peptide chain release factor 3  47.97 
 
 		 563 aa  469  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1843  peptide chain release factor 3  46.35 
 
 		 540 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3298  peptide chain release factor 3  46.1 
 
 		 540 aa  467  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2024  peptide chain release factor 3  46.08 
 
 		 539 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1999  peptide chain release factor 3  46.08 
 
 		 539 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07161  peptide chain release factor 3  46.1 
 
 		 545 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.651427  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07181  peptide chain release factor 3  45.9 
 
 		 545 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.55147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6925  peptide chain release factor 3  48.23 
 
 		 533 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2968  peptide chain release factor 3  48.44 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.720802 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14191  peptide chain release factor 3  48.96 
 
 		 571 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1198  peptide chain release factor 3  48.44 
 
 		 548 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0663  peptide chain release factor 3  44.61 
 
 		 545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.635496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1704  peptide chain release factor 3  46.14 
 
 		 542 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4287  peptide chain release factor 3  48.23 
 
 		 533 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0138  peptide chain release factor 3  44.72 
 
 		 526 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2700  peptide chain release factor 3  43.38 
 
 		 583 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1737  peptide chain release factor 3  45.07 
 
 		 524 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0192  peptide chain release factor 3  44.12 
 
 		 527 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2642  peptide chain release factor 3  45.65 
 
 		 528 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0807  peptide chain release factor 3  45.67 
 
 		 527 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.986611  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3872  peptide chain release factor 3  47.27 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3808  peptide chain release factor 3  43.28 
 
 		 538 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3254  peptide chain release factor 3  43.33 
 
 		 529 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000111312  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3761  peptide chain release factor 3  47.27 
 
 		 531 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.106529 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1821  peptide chain release factor 3  46.88 
 
 		 536 aa  435  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4253  peptide chain release factor 3  45.47 
 
 		 527 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.995333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2730  peptide chain release factor 3  45.38 
 
 		 524 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.426753  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3219  peptide chain release factor 3  44.13 
 
 		 538 aa  435  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.76683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13410  peptide chain release factor 3  44.78 
 
 		 527 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.898041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0882  peptide chain release factor 3  43.05 
 
 		 527 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1202  peptide chain release factor 3  44.58 
 
 		 527 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4579  peptide chain release factor 3  45.07 
 
 		 527 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1774  peptide chain release factor 3  44.51 
 
 		 530 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119545  normal  0.691586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2019  peptide chain release factor 3  44.85 
 
 		 542 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2819  peptide chain release factor 3  43.55 
 
 		 528 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3649  peptide chain release factor 3  43.22 
 
 		 528 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0398  peptide chain release factor 3  43.9 
 
 		 532 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1844  peptide chain release factor 3  44.4 
 
 		 541 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1764  peptide chain release factor 3  45.02 
 
 		 541 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4306  peptide chain release factor 3  45.18 
 
 		 527 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.546945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3935  peptide chain release factor 3  42.58 
 
 		 526 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0935  peptide chain release factor 3  43.06 
 
 		 526 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0583  peptide chain release factor 3  42.58 
 
 		 528 aa  428  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.704110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2112  peptide chain release factor 3  44.21 
 
 		 541 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0792  peptide chain release factor 3  45.18 
 
 		 527 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1492  peptide chain release factor 3  44.64 
 
 		 567 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4019  peptide chain release factor 3  42.39 
 
 		 526 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5160199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0872  peptide chain release factor 3  44.78 
 
 		 527 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126869  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1662  peptide chain release factor 3  46.01 
 
 		 533 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.828617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0902  peptide chain release factor 3  44.78 
 
 		 541 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.779467  normal  0.296207 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0905  peptide chain release factor 3  42.66 
 
 		 526 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2330  peptide chain release factor 3  44.26 
 
 		 535 aa  424  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4412  peptide chain release factor 3  42.35 
 
 		 527 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000888652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1434  peptide chain release factor 3  40.54 
 
 		 539 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157478  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0916  peptide chain release factor 3  44.78 
 
 		 527 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0920838  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5808  peptide chain release factor 3  44.83 
 
 		 530 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1393  peptide chain release factor 3  45.62 
 
 		 524 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263078  normal  0.346403 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3596  peptide chain release factor 3  41.38 
 
 		 529 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.750333  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04250  peptide chain release factor 3  43.49 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.631503  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4813  peptide chain release factor 3  43.66 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4609  peptide chain release factor 3  43.49 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00121865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2146  peptide chain release factor 3  45.34 
 
 		 531 aa  422  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4918  peptide chain release factor 3  43.49 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100391  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4881  peptide chain release factor 3  43.66 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3682  peptide chain release factor 3  43.49 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297475  hitchhiker  0.00075439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4916  peptide chain release factor 3  43.66 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4974  peptide chain release factor 3  43.66 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.219451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5887  peptide chain release factor 3  43.49 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.397514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4971  peptide chain release factor 3  43.49 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00185733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04216  hypothetical protein  43.49 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.659942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4968  peptide chain release factor 3  43.66 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3858  peptide chain release factor 3  46.93 
 
 		 547 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4922  peptide chain release factor 3  43.49 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.55632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>