72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3670 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3670  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  476  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3344  hypothetical protein  98.73 
 
 		 236 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  97.45 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1491  TetR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2218  regulatory protein TetR  34.87 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0300216  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  30.16 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  30.56 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2597  hypothetical protein  29.86 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323808  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  27.1 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 304 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2121  hypothetical protein  38.1 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 272 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3366  regulatory protein, TetR  25.55 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402677  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  24.32 
 
 		 311 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2128  putative transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1322  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  26.76 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  28.71 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 330 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 253 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  29.36 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 267 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 252 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 214 aa  42  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5281  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 222 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5002  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 222 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.827142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4913  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 222 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.763615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 224 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 223 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>