178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0178 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0178  phage integrase family protein  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4683  integrase family protein  87.62 
 
 		 210 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1536  phage integrase  39.41 
 
 		 201 aa  147  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0330  integrase family protein  37.37 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2340  phage integrase family protein  37.19 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0342  integrase family protein  36.5 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2725  integrase family protein  42.96 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.55 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  24.61 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  27.27 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  27.78 
 
 		 353 aa  57  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  27.23 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  28.57 
 
 		 312 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  24.75 
 
 		 354 aa  54.3  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  28.57 
 
 		 395 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  24.19 
 
 		 354 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  28.26 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  24.19 
 
 		 354 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  24.19 
 
 		 354 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  28.16 
 
 		 325 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1258  phage integrase family protein  26.95 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  29.9 
 
 		 317 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.75 
 
 		 295 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0031  resolvase  27.04 
 
 		 271 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000452405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 306 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 311 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  29.12 
 
 		 344 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 364 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 364 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0019  putative integrase/resolvase  28.8 
 
 		 263 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  28.5 
 
 		 310 aa  51.6  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 317 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  27.06 
 
 		 286 aa  50.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 		 313 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  25.77 
 
 		 304 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.36 
 
 		 309 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  28.64 
 
 		 311 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 315 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 300 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 311 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 318 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  25.15 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  27.42 
 
 		 309 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  37.33 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.81 
 
 		 297 aa  49.3  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.37 
 
 		 299 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.88 
 
 		 295 aa  49.3  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 309 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  37.18 
 
 		 304 aa  48.9  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.75 
 
 		 311 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  28.84 
 
 		 400 aa  48.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 345 aa  48.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 300 aa  48.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00956  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 305 aa  48.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0007  resolvase  25.66 
 
 		 299 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444731  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  30.06 
 
 		 367 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  36.11 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0051  resolvase  26.86 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  28.5 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  34.62 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  25.77 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  29.03 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  26.98 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  42.86 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  22.75 
 
 		 352 aa  46.6  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 294 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 		 297 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  25.5 
 
 		 308 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1628  phage integrase family protein  24.59 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.24 
 
 		 392 aa  45.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.9 
 
 		 325 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 298 aa  45.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  27.88 
 
 		 299 aa  45.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.45 
 
 		 302 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  41.27 
 
 		 256 aa  45.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.82 
 
 		 299 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.7 
 
 		 295 aa  45.4  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  24.1 
 
 		 305 aa  45.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 308 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  27.81 
 
 		 299 aa  45.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  20.12 
 
 		 297 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>