More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1258 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1258  phage integrase family protein  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0113  resolvase  34.23 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189778 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0019  putative integrase/resolvase  36.94 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4323  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.980189 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0033  Rsd  33.94 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.945608 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0038  resolvase  33.33 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0031  resolvase  33.33 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131142  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0051  resolvase  31.87 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0014  resolvase  33.19 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.921027  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0031  resolvase  34.47 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000452405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0007  resolvase  34.47 
 
 		 299 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444731  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0055  resolvase  32.02 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0024  site-specific recombinase  29.08 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.974565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0096  site-specific recombinase  28.57 
 
 		 246 aa  92  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000182797  decreased coverage  0.0000000000259535 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  29.57 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  28.51 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  30.93 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  30.49 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  30.27 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  29.57 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  29.06 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  26.92 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  25.91 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  30 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0540  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.46 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0147694  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  31.72 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  28.38 
 
 		 319 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  28.63 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.93 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  33.51 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  27.01 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  27.1 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  29.47 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  29.84 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  29.84 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  26.42 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  30.11 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  24.74 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  30.77 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  28.84 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  31.55 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  27.62 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  29.88 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  30.29 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  28.02 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  26.26 
 
 		 333 aa  62  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 318 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  31.06 
 
 		 302 aa  62  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  29.3 
 
 		 319 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  28.21 
 
 		 295 aa  62  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  30.91 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  29.86 
 
 		 311 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  26.71 
 
 		 299 aa  62  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  29.81 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.78 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  28.65 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  27.49 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.22 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  29.05 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.32 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  29.02 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  29.32 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  27.6 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  27.5 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  29.09 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.35 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.38 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  29.09 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  25.42 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.39 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  26.11 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  28.37 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.8 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.94 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  29.84 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  25.42 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  30.25 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  28.5 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.37 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  31.87 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  28.42 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>