More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0019 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0019  putative integrase/resolvase  100 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0113  resolvase  47.37 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189778 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4323  phage integrase family protein  47.37 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.980189 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0031  resolvase  46.3 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131142  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0014  resolvase  47.56 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.921027  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0051  resolvase  46.69 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0038  resolvase  45.56 
 
 		 268 aa  194  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0096  site-specific recombinase  43.48 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000182797  decreased coverage  0.0000000000259535 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0007  resolvase  45.05 
 
 		 299 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444731  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0024  site-specific recombinase  45.49 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.974565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0033  Rsd  47.35 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.945608 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0031  resolvase  46.01 
 
 		 271 aa  191  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000452405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0055  resolvase  46.67 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1258  phage integrase family protein  36.94 
 
 		 246 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  30.28 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  29.37 
 
 		 295 aa  85.5  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  29.37 
 
 		 295 aa  85.5  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.14 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  33.5 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  33.17 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  35.2 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  29.55 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  31.28 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  31.66 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.71 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  31.76 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.39 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.92 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  32.95 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.14 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  24.35 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  32.49 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  31.82 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.15 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.53 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.14 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  32.17 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  30.46 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.93 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.93 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.93 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  31.15 
 
 		 331 aa  72  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 299 aa  72  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  31.76 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  31.36 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  31.09 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  32.74 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.71 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  31.79 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  31.16 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.23 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  29.29 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  30.46 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  27.41 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  27.98 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  35.84 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  30.15 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  27.23 
 
 		 307 aa  68.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  27.32 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  31.76 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  32.34 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  27.92 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  26.53 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  27.55 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  27.72 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  27.75 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  31.95 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  25.96 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  32.12 
 
 		 328 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  26.82 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  26.63 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  32.96 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  26.42 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  29.59 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  27.46 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  30.5 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  28.71 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  26.26 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  26.36 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  25.7 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  30.39 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  27.83 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  26.82 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>