250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3922 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  899    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  55.16 
 
 
429 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  46.27 
 
 
466 aa  359  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  46.22 
 
 
467 aa  353  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  49.88 
 
 
415 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  33.48 
 
 
450 aa  189  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  34.81 
 
 
440 aa  170  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  36.73 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  29.52 
 
 
435 aa  146  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  30.44 
 
 
446 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  30.48 
 
 
455 aa  124  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  32.21 
 
 
520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  28.8 
 
 
408 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  23.13 
 
 
431 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  28.34 
 
 
408 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  28.34 
 
 
408 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  26.85 
 
 
404 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  27.82 
 
 
449 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  29.77 
 
 
405 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  31.33 
 
 
423 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  27.92 
 
 
430 aa  94.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  31.28 
 
 
575 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  26.47 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.59 
 
 
309 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.14 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.34 
 
 
296 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  26.56 
 
 
528 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  26.09 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  26.2 
 
 
302 aa  67  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  28.9 
 
 
429 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  28.07 
 
 
295 aa  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  28.62 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  34.09 
 
 
430 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  24.78 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0418  conserved repeat domain protein  28.93 
 
 
684 aa  64.3  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  29.61 
 
 
430 aa  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  21.76 
 
 
443 aa  63.9  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  29.19 
 
 
444 aa  63.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.47 
 
 
288 aa  63.2  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  25.77 
 
 
287 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.33 
 
 
297 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.91 
 
 
458 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  27.65 
 
 
310 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  27.5 
 
 
444 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  31.77 
 
 
317 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  42.67 
 
 
312 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  24.37 
 
 
444 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  27.53 
 
 
641 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  39.68 
 
 
319 aa  60.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  24.75 
 
 
451 aa  60.5  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  49.21 
 
 
309 aa  60.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  30.22 
 
 
448 aa  60.5  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2069  hypothetical protein  42.67 
 
 
312 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  29.15 
 
 
443 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  32.11 
 
 
329 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  31.76 
 
 
434 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  30.14 
 
 
324 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  35.24 
 
 
443 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  26.79 
 
 
419 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  38.46 
 
 
308 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  43.33 
 
 
312 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  29.47 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  30.53 
 
 
432 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  28.24 
 
 
444 aa  57.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.06 
 
 
287 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  21.88 
 
 
308 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1661  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  35.35 
 
 
298 aa  57.4  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2679  hypothetical protein  37.04 
 
 
311 aa  57.4  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18820  hypothetical protein  35.14 
 
 
312 aa  57.4  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000705752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  32.61 
 
 
430 aa  57  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  34.13 
 
 
433 aa  57  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  21.66 
 
 
444 aa  56.6  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  33.03 
 
 
314 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  28.12 
 
 
436 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  31.9 
 
 
473 aa  56.6  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  28.05 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  33.04 
 
 
340 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  26.92 
 
 
443 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  41.67 
 
 
318 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  40 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  31.43 
 
 
317 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  28.74 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  42.86 
 
 
318 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  31.47 
 
 
310 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2337  protein of unknown function DUF58  31.52 
 
 
437 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  hitchhiker  0.0000275371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  25.47 
 
 
295 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  24.83 
 
 
295 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1626  hypothetical protein  44.44 
 
 
309 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  30.07 
 
 
436 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1595  protein of unknown function DUF58  38 
 
 
317 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.949251  hitchhiker  0.000000583648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2783  hypothetical protein  38 
 
 
317 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  28.85 
 
 
444 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  25.24 
 
 
469 aa  54.3  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  24.82 
 
 
638 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2858  hypothetical protein  38 
 
 
317 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.187319  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>