More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3668 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3668  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 408 aa  781    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  normal  0.14919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1844  sodium/hydrogen exchanger  68.38 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0398  sodium/hydrogen exchanger  68.8 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1837  sodium/hydrogen exchanger  67.69 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.990768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2613  sodium/hydrogen exchanger  63.14 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000102886  normal  0.0926259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1741  sodium/hydrogen exchanger  63.45 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0450765  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0033  sodium/hydrogen exchanger  34.84 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0463776  normal  0.0829508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3070  Na(+)/H(+) antiporter  30.56 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.251122  normal  0.564487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3028  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 		 421 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.708162  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17191  Na+/H+ antiporter, CPA1 family protein  33.16 
 
 		 396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3326  sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 		 413 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  30.93 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3971  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1580  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2102  Sodium/hydrogen exchanger  26.34 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2072  Sodium/hydrogen exchanger  29.71 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0607  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 		 435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.979638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2399  sodium/hydrogen exchanger  29.83 
 
 		 530 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00231654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2449  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 		 608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0416  sodium/hydrogen exchanger  30.41 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  30 
 
 		 580 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1460  sodium/hydrogen exchanger  31.9 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  30 
 
 		 598 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1700  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  22.9 
 
 		 478 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5351  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.822179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  28.38 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3897  sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.415148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  28.14 
 
 		 572 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1350  Sodium/hydrogen exchanger  33.24 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.786276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2328  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.97 
 
 		 448 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  30.36 
 
 		 580 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  26.62 
 
 		 575 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  26.62 
 
 		 575 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1385  sodium/hydrogen exchanger  29.94 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00199294  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  24.02 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0349  sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0119612  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  26.93 
 
 		 581 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1079  potassium/proton antiporter  30.42 
 
 		 610 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  27.25 
 
 		 577 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  27.21 
 
 		 497 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  26.45 
 
 		 597 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  28.34 
 
 		 487 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  28.07 
 
 		 573 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0160  potassium/proton antiporter  28.13 
 
 		 498 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2517  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.82 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5291  sodium/hydrogen exchanger  29.4 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0939139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 598 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1375  sodium/hydrogen exchanger  31.19 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.64138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  27.27 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0746  potassium/proton antiporter  29.76 
 
 		 498 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  25.98 
 
 		 576 aa  97.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  28.42 
 
 		 500 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1305  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  28.57 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.382768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1073  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4033  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.697017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  25 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  30.05 
 
 		 580 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  24.65 
 
 		 581 aa  93.6  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  27.42 
 
 		 577 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  25.52 
 
 		 576 aa  93.2  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  27.42 
 
 		 577 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  27.42 
 
 		 577 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  27.42 
 
 		 577 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  27.42 
 
 		 577 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  26.3 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  29.59 
 
 		 580 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  29.59 
 
 		 580 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  28.36 
 
 		 580 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  25.52 
 
 		 576 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  28.12 
 
 		 582 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1397  sodium/hydrogen exchanger  27.79 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  30.56 
 
 		 505 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  28.72 
 
 		 580 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  25.52 
 
 		 576 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  25.52 
 
 		 576 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  24.15 
 
 		 485 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  27.97 
 
 		 573 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  26.37 
 
 		 496 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  22.16 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  29.27 
 
 		 580 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0337  potassium/proton antiporter  27.7 
 
 		 597 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  25.13 
 
 		 574 aa  90.5  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  25.45 
 
 		 574 aa  90.5  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0432  potassium/proton antiporter  28.2 
 
 		 597 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5283  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 		 491 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5575  sodium/hydrogen exchanger  27.01 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  23.64 
 
 		 498 aa  89.7  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  26.82 
 
 		 597 aa  89.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  23 
 
 		 531 aa  89.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1720  sodium/hydrogen exchanger  29.05 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  28.82 
 
 		 498 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  28.42 
 
 		 501 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4348  sodium/hydrogen exchanger  32.06 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0443638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  29.64 
 
 		 616 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0122  sodium/hydrogen exchanger  27.05 
 
 		 570 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  28.65 
 
 		 596 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>