More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2902 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2902  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 321 aa  636    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187711  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3515  LysR family regulatory protein  49.84 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2019  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3896  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701022  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1708  Transcriptional regulator-like protein  36.08 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0615  transcriptional regulator, LysR family  35.58 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  0.805337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2480  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228545  normal  0.0166786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7146  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0550  transcriptional regulator, LysR family  36.83 
 
 		 329 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2790  transcriptional regulator, LysR family  38.21 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2312  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0187767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 290 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 290 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 291 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2898  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.373982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2231  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  32.97 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  28.67 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3509  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 303 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  30.04 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0335  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  29.02 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2782  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6619  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3717  transcriptional regulator, LysR family  28.8 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.168673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2608  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  31.72 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1356  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  0.0413241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.72 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2119  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  28.72 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20370  transcriptional regulator  36.16 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.975596 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6254  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  28.67 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  30.91 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5022  transcriptional regulator, LysR family  28.93 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.851594  normal  0.174295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  27.34 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3612  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11328  normal  0.0439826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0337  transcriptional regulator, LysR family  28.14 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0334498  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2254  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0160178  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4455  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1620  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  29.62 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3223  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042632  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  31.29 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4555  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.43 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4305  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.201551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  27.74 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3838  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4222  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79182  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3484  DNA-binding transcriptional regulator CynR  36.11 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.875325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  27.66 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  27.66 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  27.99 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  27.66 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  28.15 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1447  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3031  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0317613  normal  0.872582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1121  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>