More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1620 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1620  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 299 aa  607  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2254  LysR family transcriptional regulator  99.67 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0160178  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2055  LysR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 297 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.66522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 316 aa  282  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  46.76 
 
 		 316 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0634  transcriptional regulator, LysR family  47 
 
 		 310 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  44.07 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  44.07 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 314 aa  264  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  42.66 
 
 		 323 aa  259  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  44.17 
 
 		 301 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1091  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2625  transcriptional regulator  42.96 
 
 		 313 aa  248  8e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.172216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0852  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1245  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000547224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  41.14 
 
 		 316 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  43.19 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  41.28 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  41.28 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1692  rubisco operon transcriptional regulator  41.32 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.250885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0873  transcriptional regulator, LysR family  42.42 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.164971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1390  transcriptional regulator, LysR family  41.32 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1502  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  41.67 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2835  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0138  ndhF3 operon transcriptional regulator  44.53 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184087  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3039  rubisco operon transcriptional regulator  39.8 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.670925  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0213  transcriptional regulator, LysR family  41.08 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2047  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  39.06 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.595043  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 320 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1988  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0141535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2282  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0425  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 301 aa  215  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2790  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 309 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  38.98 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71750  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4697  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168024  normal  0.0438452 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6474  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 327 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.254118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6226  putative transcriptional regulator  38.31 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5641  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5126  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3968  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456128  normal  0.373765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4657  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1550  LysR, substrate-binding  40 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5512  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 311 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.46 
 
 		 316 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5348  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5397  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal  0.012277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3723  LysR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  hitchhiker  0.00150053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5257  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3755  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0901244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3442  LysR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 332 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0866  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 325 aa  205  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4365  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000557933  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3106  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0930  LysR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0920  transcriptional regulator, LysR family  38.99 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0896  LysR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6028  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0835  LysR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2263  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3757  rubisco operon transcriptional regulator  36.96 
 
 		 330 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2695  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.537624  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1326  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 316 aa  201  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1743  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2639  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3083  LysR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0693  RuBisCo operon transcriptional regulator  38.57 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02040  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.65232  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1096  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.816594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4480  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.678379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0426  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2401  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.38508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1979  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4477  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1190  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0602294 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3927  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0151665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5950  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 323 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4312  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0433194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5931  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145733  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1394  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1508  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000734154  hitchhiker  0.000350474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2414  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2983  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 326 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4320  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279054  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5002  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5858  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.845274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1827  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140863  hitchhiker  0.00393629 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3242  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.42821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>