More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2643 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  66.39 
 
 		 243 aa  308  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  63.31 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  62.55 
 
 		 279 aa  285  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  66.67 
 
 		 256 aa  284  9e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  62.71 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  58.47 
 
 		 255 aa  278  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  61.04 
 
 		 253 aa  278  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  64.68 
 
 		 258 aa  278  8e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  62.55 
 
 		 280 aa  276  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  59.34 
 
 		 269 aa  272  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  63.45 
 
 		 277 aa  270  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  61.4 
 
 		 268 aa  268  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  59.91 
 
 		 243 aa  268  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  59.32 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  56.43 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  60 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  56.02 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  55.93 
 
 		 455 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.72 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.96 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  54.39 
 
 		 259 aa  262  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  57.83 
 
 		 253 aa  261  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  54.77 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  54.55 
 
 		 252 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  57.74 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  56.2 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  59.24 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  61.64 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  54.85 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  51.85 
 
 		 277 aa  254  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  56.28 
 
 		 261 aa  254  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  55.93 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  54.85 
 
 		 255 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  59.47 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  54.08 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  56.39 
 
 		 445 aa  251  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  57.02 
 
 		 249 aa  251  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  62 
 
 		 244 aa  251  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  57.71 
 
 		 272 aa  251  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  53.68 
 
 		 264 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  56.25 
 
 		 288 aa  248  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  52.44 
 
 		 253 aa  248  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.05 
 
 		 269 aa  247  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  52.14 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  54.08 
 
 		 266 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 312 aa  244  6.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  55.95 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 255 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.41 
 
 		 245 aa  242  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  60.56 
 
 		 224 aa  238  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  55.56 
 
 		 302 aa  236  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  61.5 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  53.95 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  55.27 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  53.85 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  55.66 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  58.18 
 
 		 247 aa  224  7e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  54.2 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  58.47 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.7 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.61 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  53.91 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.89 
 
 		 226 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  52.99 
 
 		 245 aa  210  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.03 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  46.26 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  45.41 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  44.95 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 252 aa  204  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  44.59 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.95 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.68 
 
 		 239 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2490  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 270 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.755313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  46.12 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  41.13 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2420  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.658909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2162  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.754182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  43.11 
 
 		 252 aa  201  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  43.11 
 
 		 252 aa  201  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17610  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.39 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00262944  normal  0.585837 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2406  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2588  ABC transporter related  49.77 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0206492  hitchhiker  0.00398644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2146  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.278232  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  43.35 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  43.35 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  43.89 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2196  ABC transporter related  42.98 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111069  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.38 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2972  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 		 255 aa  198  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.344281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>