More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0425 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0425  HAD family hydrolase  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  0.669052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0533  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  70.61 
 
 		 240 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.454785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0489  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  71.05 
 
 		 240 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0898  phosphatase  65.79 
 
 		 246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2676  HAD family hydrolase  46.26 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  36.05 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  36.05 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  36.21 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  38.22 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  41.33 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  41.33 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  37.17 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  39.64 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0304  HAD family hydrolase  30.64 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4950  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.21 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0398  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.77 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  34.08 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0370  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.21 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0296  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.58 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0353  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.67 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0302  HAD family hydrolase  28.94 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0292  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.53 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0309  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.53 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0324  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.53 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0356  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  30.53 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2473  hydrolase  30.77 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0460809 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13001  phosphatase  25.74 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.221513  normal  0.158564 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0199  HAD superfamily hydrolase  25.23 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0592  HAD family hydrolase  25.65 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0578  HAD family hydrolase  25.65 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297181  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1831  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.43 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1857  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.43 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3479  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.34 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.14 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.14 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  29.26 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.57 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0467  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4131  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.89 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000103032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  28.32 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  27.94 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.81 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  31.53 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  23.01 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  27.35 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  26.57 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22171  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.2 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  31.45 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3095  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.62 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0156733  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4164  HAD family hydrolase  30.63 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0540485  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.52 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.97 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.73 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  31.87 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.87 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  34.94 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  27.67 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  27.92 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03461  phosphatase  23.67 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  24.35 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  32.97 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.73 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  22.66 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  27.56 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  31.19 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  27.4 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  31.13 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  31.13 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  32.97 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  32.97 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  24.65 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  32.97 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  25.96 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  24.05 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0693  hypothetical protein  26 
 
 		 277 aa  52  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0116398  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  25.84 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  29.09 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  26.36 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  23.32 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  31.87 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  24.12 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2291  HAD family hydrolase  25.4 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  27.61 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  26.07 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  31.34 
 
 		 263 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  25.85 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.61 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  25.85 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1868  hypothetical protein  28.05 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>