More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3620 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 235 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  46.25 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  45.83 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  48.5 
 
 		 241 aa  201  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.12 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  49.12 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 240 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.9 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  43.57 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  46.5 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  46.5 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  44.07 
 
 		 255 aa  194  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 275 aa  194  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  50.22 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.26 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  45 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.53 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  47.9 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  44.73 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 240 aa  191  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2235  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  46.09 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.68 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 251 aa  184  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  44.03 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  44.03 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  43.98 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.62 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  44.03 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3731  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.42 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  44.49 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  48.03 
 
 		 267 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  44.12 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  44.03 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  44.12 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1998  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0541046  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  43.21 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  40.42 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  44.07 
 
 		 247 aa  181  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  45.15 
 
 		 245 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  45.22 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  45.22 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  40.34 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.46 
 
 		 247 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  41 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  42.8 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  46.72 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2147  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  44.78 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  44.78 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  44.78 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  43.91 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 262 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  44.74 
 
 		 257 aa  178  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  43.91 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  43.91 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  43.39 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  43.91 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  43.91 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  43.04 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  44.35 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  42.92 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0271  winged helix family two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>