More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3395 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 294 aa  588  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 297 aa  296  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 300 aa  292  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 296 aa  291  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  48.44 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  48.44 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  48.44 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  48.64 
 
 		 312 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  49.49 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 297 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 298 aa  279  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  47.59 
 
 		 301 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 307 aa  278  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  47.08 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  47.28 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  46.1 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 310 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 310 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 310 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 304 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  51.86 
 
 		 298 aa  265  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  45.89 
 
 		 305 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  44.75 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 314 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 304 aa  258  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 297 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  46.94 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  45.49 
 
 		 303 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.56 
 
 		 297 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  44.03 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 302 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 301 aa  255  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 298 aa  255  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 297 aa  255  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 297 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 305 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 300 aa  251  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  47.96 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  43.3 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  43 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 312 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  46.6 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 308 aa  248  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 311 aa  248  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  43.88 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2027  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.446931  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  46.21 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  46.42 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  46.42 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  44.22 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.63 
 
 		 298 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 310 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>