More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1158 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  100 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  54.01 
 
 		 168 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  42.14 
 
 		 165 aa  115  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 384 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  42.52 
 
 		 207 aa  101  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  34.46 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  35.97 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  39.71 
 
 		 231 aa  95.9  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 216 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  32.16 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  39.84 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  41.8 
 
 		 207 aa  91.7  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  42.4 
 
 		 257 aa  91.3  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  37.3 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  39.02 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  37.11 
 
 		 217 aa  87.4  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  36.29 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  40.48 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  40.34 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 255 aa  85.1  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  35.2 
 
 		 391 aa  84.3  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  32.48 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  43.93 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  36.29 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  34.57 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 260 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  44.14 
 
 		 476 aa  82  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 274 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3653  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 232 aa  81.3  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013969  normal  0.207873 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  37.72 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  30.56 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  31.37 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  37.72 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  49.33 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  33.95 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  36.02 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  38.58 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  37.72 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  31.93 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  38.17 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  36.09 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  36.09 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  36.09 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  36.09 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  36.09 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  36.09 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  36.09 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  37.21 
 
 		 424 aa  78.6  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  38.33 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  31.33 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  39.67 
 
 		 353 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  37.3 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  38.52 
 
 		 407 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  39.83 
 
 		 354 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  37.3 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  35 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  35.94 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  37.3 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  32.35 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  37.7 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  36.72 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  36.72 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  40.52 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  32.56 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  36.72 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  36.72 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  36.72 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  36.09 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  36.72 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  36.72 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  30.92 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  29.44 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  29.21 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  36.51 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  35.56 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  37.61 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  30.92 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  28.67 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  35.29 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  37.12 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  30.92 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  31.65 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  38.66 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  36.89 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  36.51 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>