88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0334 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0334  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  100 
 
 		 318 aa  653    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.212034  normal  0.78899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1892  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.13 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5021  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.33 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5169  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.11 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.0119355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.85 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.340783  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3653  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.2 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2188  xylose isomerase domain-containing protein  34.08 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1075  xylose isomerase domain-containing protein  34.52 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00428  Twin-arginine translocation pathway signal  37.82 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.23 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  hitchhiker  0.00235403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2692  twin-arginine translocation pathway signal  33.1 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3435  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.56 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0527  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.06 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1695  sugar phosphate isomerases/epimerases  30.93 
 
 		 285 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0560599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0088  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.28 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2156  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.03 
 
 		 241 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0395  xylose isomerase domain-containing protein  29.82 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0482433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1938  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.37 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000239688  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1628  xylose isomerase domain-containing protein  29.08 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0136  xylose isomerase domain-containing protein  28.27 
 
 		 250 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4611  xylose isomerase domain-containing protein  31 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.805097  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1893  xylose isomerase domain-containing protein  30.39 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3167  twin-arginine translocation pathway signal  28.62 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6351  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.11 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1892  xylose isomerase domain-containing protein  30.96 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0241791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11160  sugar phosphate isomerase/epimerase  29.66 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0839384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3337  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.24 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.562048  normal  0.679518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2705  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.27 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.917825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3491  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.39 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.642855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3285  xylose isomerase domain-containing protein  31.44 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2652  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.01 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000202898  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0432  xylose isomerase domain-containing protein  27.62 
 
 		 258 aa  93.6  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1429  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.45 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000502947  normal  0.0400752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4324  xylose isomerase domain-containing protein  24.61 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1272  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.66 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2333  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.33 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3458  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1192  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.41 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3062  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.26 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1198  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.49 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27510  sugar phosphate isomerase/epimerase  28.47 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.04 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1595  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.99 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1723  xylose isomerase domain-containing protein  32.52 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0574  xylose isomerase domain-containing protein  27.09 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0784  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.53 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.838141 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2406  hypothetical protein  31.47 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1543  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.37 
 
 		 245 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.482416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0747  xylose isomerase domain-containing protein  22.97 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0252  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.09 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4404  xylose isomerase domain-containing protein  22.61 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2093  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.29 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446343  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3722  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.7 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0190729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3701  hypothetical protein  23.19 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.57 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4327  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.543415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1046  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.51 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0425  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.2 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20260  sugar phosphate isomerase/epimerase  24.08 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.239255  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1158  xylose isomerase-like TIM barrel  24.22 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0365  xylose isomerase domain-containing protein  23.13 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0886  xylose isomerase domain-containing protein  25.3 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.490019 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4661  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.34 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03870  xylose isomerase-like enzyme  31.21 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5339  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.24 
 
 		 250 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00377604  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2541  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.74 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0439  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.49 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.647818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2336  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.49 
 
 		 245 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.791708  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1739  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.97 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.125041  normal  0.800521 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  25.3 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3498  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  28.81 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503466  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0621  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.69 
 
 		 281 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  24.7 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0735  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.2 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  32.09 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22460  sugar phosphate isomerase/epimerase  25.19 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.04 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  23.49 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  23.49 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  23.49 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.33 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.26 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0824  xylose isomerase domain-containing protein  25.62 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  28.68 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  30 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  27.07 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  31.06 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2972  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.05 
 
 		 245 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>