113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  510  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  59.92 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  56.03 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  48.09 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  47.21 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  43.4 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  45.73 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  45.22 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  41.63 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  47.81 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  48.25 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  42.22 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  43.35 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  40.25 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 238 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  41.74 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  44.3 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  42.99 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  39.64 
 
 		 230 aa  128  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  35.93 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  34.93 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 229 aa  98.6  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  43.43 
 
 		 422 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  27.73 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 158 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 151 aa  48.9  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 152 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  62.86 
 
 		 173 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  30.23 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 138 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  43.84 
 
 		 137 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 168 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  40.32 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 162 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  60 
 
 		 159 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  43.55 
 
 		 154 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  60 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  60 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  57.14 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1336  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 134 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  60 
 
 		 171 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 133 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  60 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  60 
 
 		 171 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  60 
 
 		 163 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  45.65 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  60 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  57.14 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  60 
 
 		 157 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 138 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  60 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0157  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  57.58 
 
 		 147 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 138 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  39.68 
 
 		 153 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 149 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.94 
 
 		 154 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  57.14 
 
 		 159 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  45.24 
 
 		 150 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  26.59 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 128 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  47.73 
 
 		 164 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 155 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  36.71 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  51.43 
 
 		 135 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 146 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 147 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5640  transcriptional regulator, MerR family  52.94 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  46.03 
 
 		 129 aa  43.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  51.28 
 
 		 96 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  36.9 
 
 		 116 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>