57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0789 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  97.8 
 
 		 318 aa  624  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  93.08 
 
 		 318 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  88.99 
 
 		 318 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  78.48 
 
 		 318 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  77.04 
 
 		 318 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  76.42 
 
 		 318 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  76.73 
 
 		 318 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  76.42 
 
 		 318 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  47.27 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  48.34 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  47.96 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  49.48 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  47.57 
 
 		 313 aa  279  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  45.17 
 
 		 309 aa  248  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  34.85 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  34.32 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  28.39 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  28.34 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  27.95 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  23.59 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  30.72 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  34.69 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  24.46 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  25.11 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  25.44 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  22.77 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  23.64 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  25.99 
 
 		 254 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  24.87 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  22.45 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3342  hypothetical protein  23.5 
 
 		 232 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.162621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  27.13 
 
 		 274 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  29.03 
 
 		 268 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  23.66 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  24 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  32.76 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  31.13 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  23.27 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  30.71 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  30.06 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  26.6 
 
 		 277 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  30.92 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  24.32 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  21.46 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  27.01 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  32.26 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  22.44 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  25.41 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  25.29 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  24.63 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  29.21 
 
 		 231 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  24.16 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  23.58 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 251 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  32.35 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>