276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24800 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24800  transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  466  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  27.85 
 
 		 294 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 		 288 aa  92.8  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  28.96 
 
 		 305 aa  92.4  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  25.82 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  24.88 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  24.88 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  24.88 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 289 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2462  transcriptional regulator, LysR family  24.31 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  27.09 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 295 aa  75.1  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  24.23 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1277  transcriptional regulator, LysR family  21.08 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  25.57 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 308 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  22.47 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  22.47 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02650  putative malonate utilization transcriptional regulator  20 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883739  normal  0.518056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38680  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  20.35 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0175  LysR family transcriptional regulator  23 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  20.39 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0301  malonate utilization transcriptional regulator  20 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 303 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 316 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  25.11 
 
 		 301 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2874  LysR family transcriptional regulator  18.27 
 
 		 303 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0140369  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0334  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 320 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  27.07 
 
 		 312 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  21.13 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1196  LysR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 293 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  22.51 
 
 		 292 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3454  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 418 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.321587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3256  LysR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 292 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  23.55 
 
 		 298 aa  52.4  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.81 
 
 		 300 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 314 aa  52  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 292 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2743  LysR family transcriptional regulator  18.96 
 
 		 303 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 314 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 301 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 303 aa  51.6  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 317 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1666  transcriptional regulator, LysR family  27.11 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.883412  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  24.8 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  20.25 
 
 		 300 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  20.6 
 
 		 300 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 316 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  24.8 
 
 		 299 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  24.8 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  20.25 
 
 		 300 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  24.8 
 
 		 299 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  24.8 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  20.41 
 
 		 294 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  24.8 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5512  transcriptional regulator, LysR family  22.44 
 
 		 311 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  20.38 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  23.58 
 
 		 298 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6967  transcriptional regulator, LysR family  22.39 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  24.57 
 
 		 295 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 312 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001561  transcriptional regulator LysR family  24.52 
 
 		 296 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3612  LysR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 296 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.07 
 
 		 304 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  23.14 
 
 		 298 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0639  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 296 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 308 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  19.83 
 
 		 300 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  19.83 
 
 		 300 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  20.17 
 
 		 300 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.56 
 
 		 293 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>