More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0100 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0100  histidine kinase  100 
 
 
572 aa  1152    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102093  normal  0.549311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4054  histidine kinase  43.94 
 
 
547 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4735  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
594 aa  349  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 
608 aa  200  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  hitchhiker  0.000174254 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.87 
 
 
607 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.15 
 
 
613 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0782  Signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
611 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0955  putative two-component regulator histidine sensor kinase  26.59 
 
 
602 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0633  MmoS, putative  26.59 
 
 
602 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0794  sensory box histidine kinase/response regulator  26.76 
 
 
602 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214236  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 
603 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0491  signal transduction histidine kinase-like protein  32.06 
 
 
617 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146334  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 
737 aa  161  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4148  histidine kinase  25.33 
 
 
610 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4800  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 
610 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3368  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 
610 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390016  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 
695 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2888  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.55 
 
 
606 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  28.27 
 
 
710 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 
952 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3302  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.18 
 
 
606 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
1055 aa  150  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  30.52 
 
 
1040 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
662 aa  146  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 
1044 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
1323 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 
913 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
1078 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
1350 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
947 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 
902 aa  144  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 
554 aa  144  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  29.4 
 
 
945 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.85 
 
 
1069 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.86 
 
 
593 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.14 
 
 
601 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.86 
 
 
760 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 
957 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 
1344 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0392  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
762 aa  140  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  30.82 
 
 
742 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  28.8 
 
 
1346 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.14 
 
 
1029 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
785 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
823 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 
939 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
869 aa  139  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 
947 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  28.07 
 
 
733 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
730 aa  138  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  31.69 
 
 
1323 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 
1059 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1055  sensor histidine kinase/response regulator  31.1 
 
 
514 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 
1009 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  29.16 
 
 
858 aa  136  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 
813 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  30.43 
 
 
724 aa  136  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 
868 aa  137  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 
641 aa  136  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.13 
 
 
1287 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.29 
 
 
934 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  26.98 
 
 
1303 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02280  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.76 
 
 
509 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  28.21 
 
 
1127 aa  136  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 
1767 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  27.7 
 
 
1287 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 
738 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 
962 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  28.64 
 
 
923 aa  135  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  27.32 
 
 
1626 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 
1596 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 
1433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 
1044 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 
973 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 
645 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 
1101 aa  134  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  26.75 
 
 
666 aa  134  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
654 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  24.79 
 
 
751 aa  134  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1383  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 
642 aa  133  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 
667 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1753  sensor protein LuxQ  28.5 
 
 
583 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.23 
 
 
1177 aa  133  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 
639 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 
862 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3808  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 
808 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0284545  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3921  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 
808 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.799409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.23 
 
 
896 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  28.3 
 
 
797 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 
1358 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  28.16 
 
 
735 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 
676 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0844  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  29.35 
 
 
669 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.644717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 
1767 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 
1767 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 
874 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
573 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 
1771 aa  131  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
1033 aa  131  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5320  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
903 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>