68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2850 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  86.5 
 
 
670 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  100 
 
 
588 aa  1195    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  93.03 
 
 
561 aa  1085    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  86.23 
 
 
670 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  94.64 
 
 
413 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  84.56 
 
 
473 aa  435  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  83.66 
 
 
540 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  83.66 
 
 
540 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  65.12 
 
 
399 aa  389  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  66.3 
 
 
697 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  63.52 
 
 
646 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  62.66 
 
 
485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  63.85 
 
 
401 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  63.43 
 
 
419 aa  282  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  91.14 
 
 
583 aa  282  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  71.67 
 
 
479 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  64.13 
 
 
498 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  65.47 
 
 
557 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  58.99 
 
 
371 aa  258  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  55.09 
 
 
673 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  62.78 
 
 
340 aa  246  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  52.4 
 
 
452 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  58.14 
 
 
399 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  71.43 
 
 
660 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  50.86 
 
 
689 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  55.77 
 
 
504 aa  181  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  56.49 
 
 
714 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  55.56 
 
 
554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  54.49 
 
 
570 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  52.94 
 
 
554 aa  164  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  48.1 
 
 
493 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  48.1 
 
 
552 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  49.02 
 
 
581 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  52.83 
 
 
580 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  44.52 
 
 
251 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  45.33 
 
 
817 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  57.5 
 
 
463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  42.04 
 
 
691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  52.85 
 
 
621 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  63.95 
 
 
462 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  51.49 
 
 
689 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  36.61 
 
 
242 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  59.8 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  48.57 
 
 
962 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  36.96 
 
 
505 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  59.82 
 
 
791 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  39.46 
 
 
483 aa  110  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  55.37 
 
 
790 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  36.96 
 
 
205 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  60.36 
 
 
892 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  33.33 
 
 
359 aa  103  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  59.8 
 
 
280 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  60.92 
 
 
805 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  32.89 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  34.44 
 
 
519 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  63.64 
 
 
682 aa  75.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  63.51 
 
 
522 aa  75.5  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  51.76 
 
 
639 aa  71.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  48.42 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  33.57 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  33.11 
 
 
525 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  29.6 
 
 
469 aa  60.8  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  37.5 
 
 
304 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  60 
 
 
387 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  29.8 
 
 
590 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  56.41 
 
 
397 aa  49.7  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  42.86 
 
 
385 aa  48.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  26.81 
 
 
520 aa  43.9  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>