More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1260 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1260  Helix-turn-helix, AraC domain protein  100 
 
 		 339 aa  697    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0717392  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 344 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 382 aa  89.7  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  26.32 
 
 		 348 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  26.84 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  26.2 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2412  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 386 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6270  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 340 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  31.06 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  24.65 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1559  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 353 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 353 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 353 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 350 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0399  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  25.15 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04000  putative transcriptional regulator  28.63 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  28.51 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  30.05 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  26.22 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4239  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  26.05 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  23.84 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  25.69 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  25.89 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5805  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597808  normal  0.277234 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  24.18 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  24.18 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  25.89 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  26.46 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  26.02 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  30.39 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  26.07 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0743  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4290  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5980  transcriptional regulator, AraC family  27.53 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  26.12 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  26.12 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  24.52 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  24.41 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.64 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0082  hypothetical protein  27.86 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00626494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>