128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2710 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  81.82 
 
 
601 aa  1045    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  79.25 
 
 
629 aa  1060    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  79.97 
 
 
631 aa  1051    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  78.66 
 
 
631 aa  1048    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  100 
 
 
642 aa  1337    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  93.61 
 
 
642 aa  1240    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  98.44 
 
 
642 aa  1316    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  56.42 
 
 
604 aa  683    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  98.91 
 
 
642 aa  1323    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  56.25 
 
 
604 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  59.14 
 
 
819 aa  759    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  98.75 
 
 
642 aa  1318    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  53 
 
 
614 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  49.21 
 
 
842 aa  626  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  52.83 
 
 
614 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  50.09 
 
 
608 aa  598  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  48.69 
 
 
635 aa  594  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  49.5 
 
 
625 aa  589  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  49.15 
 
 
613 aa  581  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  48.55 
 
 
596 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  48.21 
 
 
596 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  47.31 
 
 
597 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  47.21 
 
 
594 aa  571  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  47.72 
 
 
607 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  44.84 
 
 
602 aa  506  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  44.75 
 
 
799 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  39.53 
 
 
639 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  37.13 
 
 
615 aa  410  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  35.59 
 
 
601 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  35 
 
 
614 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  34.92 
 
 
813 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  32.46 
 
 
621 aa  304  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  32.97 
 
 
599 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  30.04 
 
 
577 aa  274  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  29.37 
 
 
580 aa  270  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  31.35 
 
 
616 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.19 
 
 
580 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  30.85 
 
 
621 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  30 
 
 
582 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  29.77 
 
 
615 aa  261  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.48 
 
 
582 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.48 
 
 
582 aa  258  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  29.48 
 
 
582 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  29.11 
 
 
572 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  27.15 
 
 
578 aa  228  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  27.41 
 
 
716 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.65 
 
 
612 aa  220  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  25.04 
 
 
610 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  25.04 
 
 
610 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  25.04 
 
 
610 aa  219  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  27.79 
 
 
619 aa  219  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  25.04 
 
 
612 aa  219  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  25.04 
 
 
610 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.94 
 
 
612 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  28.38 
 
 
618 aa  211  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  28.72 
 
 
617 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  23.17 
 
 
613 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  27.16 
 
 
589 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  29.19 
 
 
1148 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  24.96 
 
 
1153 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.4 
 
 
998 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  25.95 
 
 
562 aa  163  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  27.17 
 
 
998 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  27.12 
 
 
991 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.43 
 
 
592 aa  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.43 
 
 
592 aa  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.67 
 
 
577 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  24.26 
 
 
577 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  23.65 
 
 
615 aa  127  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  22.64 
 
 
580 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  22.86 
 
 
580 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  24.12 
 
 
633 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  20.56 
 
 
588 aa  91.7  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  24.12 
 
 
575 aa  82.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  24.06 
 
 
720 aa  81.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  23.53 
 
 
613 aa  80.9  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  22.49 
 
 
655 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  23.47 
 
 
575 aa  77.8  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  21.58 
 
 
655 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  21.59 
 
 
563 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  22.06 
 
 
610 aa  74.7  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  22.3 
 
 
610 aa  68.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  23.99 
 
 
578 aa  67.4  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  22.42 
 
 
637 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  19.69 
 
 
925 aa  61.6  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  23.49 
 
 
584 aa  61.2  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  23.49 
 
 
584 aa  61.2  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  22.2 
 
 
599 aa  61.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  23.89 
 
 
587 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  23.24 
 
 
589 aa  57.4  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  24.13 
 
 
557 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  21.73 
 
 
810 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  22.89 
 
 
592 aa  56.6  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  23.6 
 
 
584 aa  55.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  22.11 
 
 
519 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  22.06 
 
 
576 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  21.86 
 
 
606 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  21.82 
 
 
608 aa  55.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  19.75 
 
 
602 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  19.75 
 
 
602 aa  53.9  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>