More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4343 on replicon NC_011664
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  100 
 
 		 202 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  56.41 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  60 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  60 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  54.46 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  55.17 
 
 		 211 aa  215  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  52.66 
 
 		 214 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  52.5 
 
 		 206 aa  211  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  52.45 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  53.23 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  52.68 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  52.74 
 
 		 210 aa  205  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  55.67 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  51.74 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  51 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  50.25 
 
 		 205 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  49.02 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  48.53 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  52.71 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  46.8 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  46.73 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  47.24 
 
 		 200 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  46.73 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  46.73 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  46.23 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  46.23 
 
 		 209 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  45.54 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  43.65 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  45.71 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  43.07 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  43.28 
 
 		 228 aa  157  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  43.4 
 
 		 222 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  39.31 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  33.33 
 
 		 283 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  33.85 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  36 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  33.85 
 
 		 245 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  34.38 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  38.32 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2479  hypothetical protein  43.27 
 
 		 138 aa  88.2  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.802993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2019  resolvase family site-specific recombinase  53.16 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0026  resolvase family site-specific recombinase  45.36 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000122476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  31.68 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  32.14 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  31.84 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  30.3 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  30.85 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  28.71 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  34.13 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  30 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  29.06 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  31.09 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  31.63 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  32.66 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  30.65 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  30.69 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  32.84 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  32.49 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  31.5 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  31.5 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  29.59 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  29.9 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  31 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  31 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  31.28 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  29.06 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  31.68 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  31.68 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  27.72 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  29.9 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  28.93 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.59 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  29.23 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  28.93 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  28.93 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  28.93 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  29.5 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  27.92 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  28.92 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  32.28 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  29.06 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  31.33 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  31.33 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  29.3 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  31.9 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  29.56 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  28.71 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  28.71 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  32.72 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  30.25 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  28.79 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  30.38 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  29.59 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  29.49 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>