222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2972 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2972  nitrate transporter component, nrtA  100 
 
 		 402 aa  812    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  66.67 
 
 		 403 aa  532  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  47.86 
 
 		 410 aa  334  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  43.39 
 
 		 415 aa  298  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  43.75 
 
 		 403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  38.15 
 
 		 467 aa  286  5.999999999999999e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  43.21 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  43.32 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  41.31 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  40.4 
 
 		 423 aa  269  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0919  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.16 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  40.05 
 
 		 386 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  41.76 
 
 		 384 aa  266  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  39.7 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  38.52 
 
 		 392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3039  putative nitrate transport protein  40.16 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  38.64 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  38.21 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4454  putative nitrate transport protein  40.46 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  39.94 
 
 		 377 aa  239  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  35.7 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  36.76 
 
 		 407 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  34.06 
 
 		 382 aa  217  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  35.38 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4960  putative nitrate transport protein  40.06 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  34.71 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4497  putative nitrate transport protein  40.64 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  33.98 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  31.21 
 
 		 491 aa  193  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.58 
 
 		 669 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5013  putative nitrate transport protein  38.95 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.826042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  36.08 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  31.19 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  32.96 
 
 		 457 aa  186  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  32.6 
 
 		 461 aa  182  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  33.52 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  32.15 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  34.15 
 
 		 452 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  30.95 
 
 		 454 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2301  putative nitrate transport protein  38.79 
 
 		 333 aa  179  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  32.88 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  31.4 
 
 		 466 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.68 
 
 		 668 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  31.97 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  29.63 
 
 		 431 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.59 
 
 		 657 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  29.69 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  31.42 
 
 		 454 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  29.8 
 
 		 443 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  32.61 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  26.96 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  32.61 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 		 385 aa  166  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  30.99 
 
 		 407 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  30.3 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  31.5 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  29.63 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.85 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  30.75 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  31.25 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  29.06 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1734  nitrate transporter, putative  36.34 
 
 		 361 aa  162  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  31.91 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  31.16 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  30.96 
 
 		 414 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  27.52 
 
 		 437 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  34.29 
 
 		 403 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  30.96 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  35.16 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  29.12 
 
 		 425 aa  159  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  27.03 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  30.68 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.56 
 
 		 380 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  30.4 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  27.41 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  29.82 
 
 		 529 aa  157  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  28.4 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  26.87 
 
 		 450 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  34.78 
 
 		 353 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  34.78 
 
 		 353 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  34.78 
 
 		 353 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  34.78 
 
 		 353 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  30.11 
 
 		 414 aa  155  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  31.16 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  28.29 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  34.78 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  28.11 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  30.85 
 
 		 454 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  29.83 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  28.11 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  27.3 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  27.07 
 
 		 457 aa  153  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  34.49 
 
 		 353 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.74 
 
 		 427 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  28.18 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.59 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  32.59 
 
 		 404 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  26.75 
 
 		 464 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>