89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0782 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
274 aa  571  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.2 
 
 
257 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.05 
 
 
320 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.67 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.02 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.16 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.41 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.76 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  29.37 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.32 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.75 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.82 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.56 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.16 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.05 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.35 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.56 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.8 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.43 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.43 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  28.12 
 
 
289 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.51 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.56 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.97 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.29 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.89 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.06 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  30.17 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.5 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.57 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  21.46 
 
 
309 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  32 
 
 
239 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.12 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  23.6 
 
 
314 aa  56.6  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.76 
 
 
296 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
259 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.51 
 
 
271 aa  55.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.01 
 
 
260 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  23.63 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.88 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  23.93 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.23 
 
 
394 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  25.66 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  26.85 
 
 
281 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  28.4 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.02 
 
 
293 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  24.19 
 
 
302 aa  52.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.75 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.74 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.97 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  30.65 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  25.82 
 
 
300 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.25 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.66 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.05 
 
 
372 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.92 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.27 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  26.91 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  25.29 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.31 
 
 
302 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32238  predicted protein  25.68 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.194456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.36 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  33.33 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  23.33 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  28.81 
 
 
319 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.56 
 
 
274 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  23.68 
 
 
354 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  23.68 
 
 
352 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  23.68 
 
 
307 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.45 
 
 
230 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  29.66 
 
 
304 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  25.73 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.51 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  23.31 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.03 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  31 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  23.28 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  28.57 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3596  hypothetical protein  24.71 
 
 
238 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.7 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.39 
 
 
282 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  27.85 
 
 
303 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.24 
 
 
274 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  19.64 
 
 
311 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.9 
 
 
275 aa  42  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  21.49 
 
 
299 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>