More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3156 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  44.34 
 
 		 4111 aa  1818    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  47.27 
 
 		 4151 aa  1302    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  50.03 
 
 		 3033 aa  2312    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  50.62 
 
 		 1831 aa  1434    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  48.69 
 
 		 3463 aa  2546    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  55.24 
 
 		 1143 aa  874    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.42 
 
 		 1939 aa  872    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  47.94 
 
 		 3711 aa  2578    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  39.7 
 
 		 2719 aa  1049    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  43.1 
 
 		 2066 aa  1140    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  49.49 
 
 		 2367 aa  1072    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  38.64 
 
 		 2220 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  54.87 
 
 		 2376 aa  908    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  55.57 
 
 		 1071 aa  821    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  47.96 
 
 		 4840 aa  3226    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  49.77 
 
 		 3254 aa  1502    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 		 2551 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 		 1874 aa  746    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.41 
 
 		 1656 aa  721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  40.34 
 
 		 1144 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  43 
 
 		 1587 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  46.87 
 
 		 3493 aa  1678    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  55.04 
 
 		 2374 aa  893    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  38.62 
 
 		 1827 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  45.84 
 
 		 1402 aa  751    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  35.19 
 
 		 3130 aa  1108    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  43.96 
 
 		 2024 aa  993    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  40.1 
 
 		 3252 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  33.43 
 
 		 1835 aa  667    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.33 
 
 		 1832 aa  801    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  52.1 
 
 		 5154 aa  2272    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  48.72 
 
 		 1593 aa  1065    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  44.57 
 
 		 2081 aa  1094    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  39.51 
 
 		 2230 aa  747    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  34.88 
 
 		 4165 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  51.77 
 
 		 1789 aa  1474    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.89 
 
 		 7110 aa  3699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  45.11 
 
 		 4930 aa  2022    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  41.48 
 
 		 3176 aa  767    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  40.53 
 
 		 3693 aa  1412    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.87 
 
 		 3092 aa  2493    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  36.26 
 
 		 1520 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.43 
 
 		 1816 aa  1364    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  35.13 
 
 		 1580 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  40.08 
 
 		 2085 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  47.72 
 
 		 2090 aa  1328    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  48.11 
 
 		 1924 aa  1246    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.59 
 
 		 2551 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  34.92 
 
 		 1559 aa  796    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  41.42 
 
 		 1354 aa  676    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  49.05 
 
 		 5255 aa  3404    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  33.93 
 
 		 4646 aa  919    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.76 
 
 		 2333 aa  684    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  34.1 
 
 		 3093 aa  943    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.92 
 
 		 2232 aa  738    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 		 5400 aa  3485    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.26 
 
 		 4478 aa  809    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  39.02 
 
 		 1349 aa  682    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  33.89 
 
 		 1876 aa  695    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  40.53 
 
 		 3693 aa  1412    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  47.98 
 
 		 6768 aa  1349    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  36.26 
 
 		 1520 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  45.27 
 
 		 1601 aa  1038    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  35.13 
 
 		 1580 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  40.08 
 
 		 2085 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  34.54 
 
 		 5526 aa  738    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  40.75 
 
 		 3676 aa  1403    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.26 
 
 		 3874 aa  1572    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  41.32 
 
 		 3696 aa  1419    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  38.91 
 
 		 2880 aa  960    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  41.71 
 
 		 1805 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  36.86 
 
 		 3645 aa  1267    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  50.4 
 
 		 3494 aa  2790    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  32.9 
 
 		 1828 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  44.13 
 
 		 4575 aa  1200    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  53.26 
 
 		 3355 aa  1904    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  51.63 
 
 		 1548 aa  1238    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  47.43 
 
 		 1584 aa  1060    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  46.61 
 
 		 3508 aa  2466    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  36.96 
 
 		 2462 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.7 
 
 		 3099 aa  806    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  51.36 
 
 		 2126 aa  1172    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  75.63 
 
 		 2060 aa  1130    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  40.81 
 
 		 3702 aa  1419    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  49.44 
 
 		 1602 aa  1026    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.31 
 
 		 2762 aa  785    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  35.13 
 
 		 1580 aa  674    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  40 
 
 		 2085 aa  653    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  51.08 
 
 		 3408 aa  2166    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  45.76 
 
 		 3400 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  44.58 
 
 		 1017 aa  699    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 7279 aa  14240    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  41.16 
 
 		 3679 aa  1412    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  49.01 
 
 		 3158 aa  1954    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  45.62 
 
 		 1955 aa  1093    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  48.04 
 
 		 3148 aa  1499    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  38.95 
 
 		 1087 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  36.19 
 
 		 1577 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  33.4 
 
 		 1823 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  41.59 
 
 		 2047 aa  644    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>