More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2247 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  93.3 
 
 		 223 aa  390  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  67.16 
 
 		 217 aa  274  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  59.51 
 
 		 222 aa  218  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  57.56 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  51.47 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  50.96 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  49.75 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  57.87 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  49.03 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  49.03 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  51.98 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  46.6 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  47.32 
 
 		 223 aa  187  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  52.66 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  50.26 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  50.98 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  39.31 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  39.31 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  33.87 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  38.54 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  34.9 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  34.72 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  49.3 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  34.18 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  32.98 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  33.51 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.61 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.17 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  32.38 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.05 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  28.22 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  28.85 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.95 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.89 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  35.64 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  26.73 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.7 
 
 		 176 aa  62  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.89 
 
 		 166 aa  62  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.22 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  31.05 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  29.41 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  40.58 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.03 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  30.56 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.55 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.57 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.63 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.09 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  41.67 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  30.1 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.74 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  25.28 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.95 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  29.85 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  38.46 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  34.53 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  40.82 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.49 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1629  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  51.85 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.31 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  47.62 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.02 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.94 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  31.28 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.84 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  50 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.35 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  23.81 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.43 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  38.89 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  41.82 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  33.68 
 
 		 546 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  46.03 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  46.03 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  46.03 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  25.81 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.6 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  40 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  26.32 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  46.03 
 
 		 411 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  36.36 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  39.29 
 
 		 351 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  26.85 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.94 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  37.31 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  45.31 
 
 		 394 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  29.38 
 
 		 321 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  43.48 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  46.03 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  37.35 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.51 
 
 		 279 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2019  nitroreductase  25.68 
 
 		 340 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.997085  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  46.03 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4461  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.34 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.219812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  46.03 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  37.5 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>