More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1273 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1273  transketolase central region  100 
 
 		 303 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.257757  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5715  Transketolase central region  62.71 
 
 		 296 aa  356  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4002  Transketolase central region  60.94 
 
 		 299 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226763  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6362  Transketolase central region  53.38 
 
 		 307 aa  288  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.465513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4473  transketolase, central region  53.06 
 
 		 296 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0113424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4986  transketolase central region  53.4 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.545662  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  29.28 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  29.68 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  26.71 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0796  Transketolase central region  29.15 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  23.47 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  33.98 
 
 		 332 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  29.28 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  29.28 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  29.55 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  26.54 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  30.28 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  29.23 
 
 		 342 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  28.87 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2448  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  31.41 
 
 		 631 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  28.62 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0484  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.79 
 
 		 636 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0190528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0200  transketolase, C-terminal subunit  28.12 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  35.98 
 
 		 322 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0471  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.43 
 
 		 636 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  29 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  28 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  29.93 
 
 		 592 aa  94.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  27.7 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  26.58 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  29.89 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  28.57 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1852  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.57 
 
 		 640 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  30.43 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0901  transketolase, central region  29.78 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  29.51 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  25.72 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  26.35 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3373  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.57 
 
 		 639 aa  89.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1662  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.55 
 
 		 626 aa  89.4  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.184143  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  30.98 
 
 		 321 aa  89  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  25 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  27.3 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  26.82 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1069  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.92 
 
 		 643 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1430  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.1 
 
 		 643 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  28.88 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2133  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.28 
 
 		 614 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000520629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  32.82 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  28.62 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  31.67 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  24.18 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15371  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.17 
 
 		 644 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326891 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  25.16 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  30.4 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0983  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.47 
 
 		 624 aa  86.3  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  29.57 
 
 		 314 aa  86.3  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  27.54 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  27.63 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0879  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  32.42 
 
 		 618 aa  85.1  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.623076 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  28.12 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2182  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.02 
 
 		 625 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0455646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  29.61 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4569  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.76 
 
 		 635 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0614  transketolase, central region  33.33 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0832  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.54 
 
 		 640 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111285  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09721  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.04 
 
 		 628 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.274515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0686  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.12 
 
 		 637 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351489  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0300  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.04 
 
 		 628 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.533137  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4395  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.9 
 
 		 635 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326234  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08521  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.31 
 
 		 643 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.68369  hitchhiker  0.000952628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2870  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.13 
 
 		 630 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  27.3 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1018  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.06 
 
 		 637 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  27.3 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  27.04 
 
 		 636 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  28.34 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  28.57 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  26.89 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  29.03 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1917  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.7 
 
 		 637 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  27.78 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  28.57 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  28.57 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  25.55 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2615  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.77 
 
 		 637 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207867  normal  0.922526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3042  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.37 
 
 		 635 aa  82.8  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00899541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1694  1-Deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.89 
 
 		 631 aa  82.4  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.134316  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4532  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.72 
 
 		 635 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0943  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.91 
 
 		 635 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  29.15 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  25.55 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6734  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.7 
 
 		 639 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.769024  normal  0.345052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3347  Transketolase central region  29.15 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.027962  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2875  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.57 
 
 		 632 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  30.68 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1774  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.86 
 
 		 622 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0951101  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  23.38 
 
 		 635 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2033  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.89 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.720268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1097  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.95 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.124796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>