More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1813 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  53.68 
 
 
273 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  53.56 
 
 
270 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  52.26 
 
 
278 aa  279  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  52.43 
 
 
265 aa  275  7e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  49.62 
 
 
274 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  48.12 
 
 
274 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  49.06 
 
 
266 aa  258  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  47.39 
 
 
272 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  45.32 
 
 
265 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  46.44 
 
 
274 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  43.12 
 
 
268 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  40.66 
 
 
287 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  41.18 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  41.18 
 
 
296 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  41.67 
 
 
282 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  40.38 
 
 
269 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  39.63 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  38.06 
 
 
274 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  41.29 
 
 
278 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  37.83 
 
 
273 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  40.38 
 
 
269 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  37.55 
 
 
274 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  35.82 
 
 
273 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  40.15 
 
 
268 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  38.97 
 
 
279 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  37.55 
 
 
282 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  39.93 
 
 
263 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  39.41 
 
 
265 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  38.81 
 
 
266 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  38.43 
 
 
273 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  37.31 
 
 
276 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  38.06 
 
 
266 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  37.22 
 
 
264 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  37.36 
 
 
276 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  36.47 
 
 
269 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  35.56 
 
 
268 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  33.96 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  33.54 
 
 
318 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  33.54 
 
 
318 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  33.54 
 
 
318 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  33.54 
 
 
318 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  33.54 
 
 
318 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  33.54 
 
 
318 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  33.54 
 
 
318 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  32.92 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  37.55 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  37.31 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  37.69 
 
 
266 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  34.14 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  35.82 
 
 
259 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  35.32 
 
 
259 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  33.46 
 
 
277 aa  143  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  34.94 
 
 
259 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  32.74 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  33.7 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 
265 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  35.82 
 
 
259 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  33.81 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  32.86 
 
 
311 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  41.12 
 
 
334 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  41.87 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  34.16 
 
 
281 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  30.04 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  32.85 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  33.21 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  34.29 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.35 
 
 
273 aa  129  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  32.05 
 
 
329 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  33.1 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  33.33 
 
 
273 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  29.68 
 
 
318 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  33.69 
 
 
272 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  30.63 
 
 
272 aa  122  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3332  transglutaminase domain protein  32.29 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0305651  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.25 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  36.59 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4110  transglutaminase domain-containing protein  39.7 
 
 
335 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109516  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  32.85 
 
 
272 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3413  transglutaminase domain-containing protein  39.7 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.452972  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4256  transglutaminase-like  39.7 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0500098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  27.65 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  27.34 
 
 
291 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  29.87 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  31.17 
 
 
316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  28.26 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  31.42 
 
 
293 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4109  transglutaminase domain-containing protein  41.12 
 
 
331 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.52 
 
 
280 aa  111  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  30.2 
 
 
326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  29.9 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  29.15 
 
 
295 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  31.7 
 
 
340 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  29.93 
 
 
279 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  31.7 
 
 
350 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  29.93 
 
 
279 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  29.93 
 
 
279 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  31.37 
 
 
340 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  31.7 
 
 
340 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  31.37 
 
 
338 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>