93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1150 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  100 
 
 
179 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  96.09 
 
 
179 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  74.86 
 
 
177 aa  291  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  74.14 
 
 
177 aa  287  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  72.57 
 
 
177 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  72.57 
 
 
177 aa  285  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  72.99 
 
 
177 aa  283  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  72.99 
 
 
177 aa  283  7e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  72.99 
 
 
177 aa  283  7e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  72.41 
 
 
177 aa  282  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  72.41 
 
 
177 aa  280  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  72.41 
 
 
177 aa  280  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  72.25 
 
 
177 aa  279  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  71.43 
 
 
177 aa  278  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  71.43 
 
 
177 aa  278  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  71.26 
 
 
177 aa  277  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  71.26 
 
 
177 aa  277  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  70.86 
 
 
177 aa  276  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  70.29 
 
 
177 aa  276  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  69.71 
 
 
177 aa  275  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  69.23 
 
 
178 aa  264  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  67.58 
 
 
178 aa  261  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3876  lysozyme  60 
 
 
76 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2236  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  40.43 
 
 
153 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  40.43 
 
 
153 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  31.79 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  34.29 
 
 
165 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  34.29 
 
 
165 aa  84.3  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  34.29 
 
 
165 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  34.29 
 
 
163 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  34.29 
 
 
165 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  34.29 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  38.52 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  30.86 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  35.86 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  32.3 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  31.69 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  36.89 
 
 
205 aa  67.8  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  34.67 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  34.67 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 
211 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  33.59 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  34 
 
 
149 aa  61.6  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  34.19 
 
 
179 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  33.07 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  33.33 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  35 
 
 
164 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  34.83 
 
 
142 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  36.51 
 
 
136 aa  55.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  34.51 
 
 
187 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  28.57 
 
 
143 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  28.3 
 
 
153 aa  54.3  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  33.13 
 
 
163 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  35.58 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  35.58 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  36.92 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  31.2 
 
 
148 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  32.54 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  41.79 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  37.96 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 
154 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  36.92 
 
 
188 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  31.16 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  36.05 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  34.51 
 
 
209 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  36.05 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 
225 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 
225 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 
341 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  39.68 
 
 
150 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  30.32 
 
 
148 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  33.72 
 
 
166 aa  47.8  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  30.32 
 
 
148 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  33.72 
 
 
166 aa  47.8  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  39.68 
 
 
150 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  30.1 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  32.89 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  28.35 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  32.69 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  28 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  30.26 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  27.35 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  29.84 
 
 
145 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  26.39 
 
 
169 aa  42  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  34.29 
 
 
166 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>