More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1541 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1541  major facilitator transporter  100 
 
 		 491 aa  946    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2289  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 		 483 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2827  major facilitator superfamily MFS_1  48.16 
 
 		 500 aa  353  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.158214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8106  major facilitator superfamily MFS_1  43.39 
 
 		 502 aa  326  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 429 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  30.33 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  27.09 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  24.8 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  27.32 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  25.07 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  25.07 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  25.07 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  25.07 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  25.07 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  25.07 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  26.65 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 427 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  26.56 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  26.56 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  26.56 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  24.8 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  23.76 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  25.05 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  24.54 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 430 aa  67  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  28 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.65 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  26.46 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3235  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0231  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  24.63 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  24.88 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0384  major facilitator family transporter  31.97 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  23.46 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  24.06 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2519  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  36 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  24.1 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  23.9 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  25.31 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.71 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.43 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  24.04 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 417 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 425 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>