More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2519 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2519  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  100 
 
 
452 aa  877    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  53.86 
 
 
461 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  47.86 
 
 
467 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  48.18 
 
 
467 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  48.18 
 
 
467 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  45.13 
 
 
460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  44.32 
 
 
460 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  44.32 
 
 
460 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  38.78 
 
 
461 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  38.36 
 
 
453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  38.08 
 
 
452 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  38.08 
 
 
452 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  37.72 
 
 
460 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  37.56 
 
 
454 aa  257  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  37.83 
 
 
453 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  37.59 
 
 
453 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  36.88 
 
 
450 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  36.26 
 
 
449 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  36.75 
 
 
475 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  36.36 
 
 
453 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  37.92 
 
 
454 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  36.14 
 
 
447 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  36.06 
 
 
455 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  33.56 
 
 
438 aa  236  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  37.62 
 
 
451 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  37.38 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  37.38 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  38.05 
 
 
579 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  37.38 
 
 
451 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  37.38 
 
 
451 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  37.38 
 
 
451 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  37.38 
 
 
451 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  39.12 
 
 
457 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  33.57 
 
 
454 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 
454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.86 
 
 
452 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  36.43 
 
 
458 aa  232  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  35.9 
 
 
459 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  33.94 
 
 
449 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  37.16 
 
 
441 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  36.43 
 
 
453 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  36.28 
 
 
453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  36.25 
 
 
449 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  35.85 
 
 
445 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 
451 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  32.7 
 
 
451 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  34.5 
 
 
453 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  36.34 
 
 
453 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  36.34 
 
 
453 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  34.72 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  35.63 
 
 
446 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  35.14 
 
 
448 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  33.17 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  33.25 
 
 
454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  33.25 
 
 
452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  36.36 
 
 
451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  32.14 
 
 
452 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  32.69 
 
 
452 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  35.14 
 
 
448 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  35.14 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  37.39 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  34.37 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  34.42 
 
 
449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  34.72 
 
 
448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
452 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  34.55 
 
 
440 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  34.13 
 
 
452 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  34.22 
 
 
455 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6499  major facilitator transporter  34.62 
 
 
449 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270044  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  31.83 
 
 
457 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  34.69 
 
 
445 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  34.45 
 
 
442 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  32.38 
 
 
458 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  34.31 
 
 
442 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  35.34 
 
 
452 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2625  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  34.67 
 
 
466 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000676448  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4528  major facilitator superfamily transporter 4- hydroxybenzoate transporter  34.67 
 
 
466 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000028085  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  34.23 
 
 
442 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  32.74 
 
 
452 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  34.54 
 
 
465 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  34.55 
 
 
456 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  34.38 
 
 
455 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4063  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 
461 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  33.11 
 
 
454 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  30.22 
 
 
454 aa  206  9e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  31.59 
 
 
454 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4904  major facilitator transporter  35.05 
 
 
446 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  36.26 
 
 
449 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 
458 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  34.98 
 
 
448 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  34.98 
 
 
458 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  31.63 
 
 
452 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  31.63 
 
 
452 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  31.63 
 
 
452 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  34.47 
 
 
454 aa  203  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  34.93 
 
 
456 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  35.14 
 
 
450 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  35.08 
 
 
443 aa  202  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2766  MFS family transporter  36.32 
 
 
449 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.648112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  34.73 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>