152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0410 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  100 
 
 		 578 aa  1144    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  46.76 
 
 		 606 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  49.1 
 
 		 645 aa  511  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  49.49 
 
 		 591 aa  505  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  43.07 
 
 		 602 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  41.74 
 
 		 602 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  42.31 
 
 		 602 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  42.47 
 
 		 602 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  42.14 
 
 		 602 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  42.31 
 
 		 602 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  42.57 
 
 		 602 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  42.31 
 
 		 602 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  46.55 
 
 		 601 aa  460  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  47.33 
 
 		 601 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  39.9 
 
 		 610 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  31.46 
 
 		 810 aa  316  8e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  37.27 
 
 		 609 aa  309  8e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  36.84 
 
 		 672 aa  307  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  36.29 
 
 		 596 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  40 
 
 		 570 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  36.39 
 
 		 593 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  36.97 
 
 		 594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  36.97 
 
 		 594 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  31.87 
 
 		 818 aa  284  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  36.49 
 
 		 595 aa  276  8e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  34.07 
 
 		 584 aa  263  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  35.7 
 
 		 588 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  32.63 
 
 		 610 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  30.68 
 
 		 613 aa  237  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  31.83 
 
 		 925 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  30.96 
 
 		 611 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  29.45 
 
 		 574 aa  207  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  29.74 
 
 		 574 aa  206  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  30.22 
 
 		 574 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  32.99 
 
 		 1153 aa  193  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  30.02 
 
 		 581 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  30.36 
 
 		 1148 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  29.61 
 
 		 590 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  29.61 
 
 		 590 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  28.22 
 
 		 560 aa  189  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  33.26 
 
 		 608 aa  183  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  29.15 
 
 		 586 aa  181  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  30.7 
 
 		 578 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  30.7 
 
 		 578 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  32.07 
 
 		 586 aa  174  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  31.34 
 
 		 584 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  29.06 
 
 		 580 aa  170  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  30.25 
 
 		 599 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  26.95 
 
 		 684 aa  157  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  29.72 
 
 		 519 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  30.06 
 
 		 576 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  29.52 
 
 		 594 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  28.75 
 
 		 555 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  25.72 
 
 		 628 aa  114  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  27.25 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  32.43 
 
 		 562 aa  103  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  28.72 
 
 		 615 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  30.25 
 
 		 577 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  29.83 
 
 		 991 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  28.79 
 
 		 577 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  24.93 
 
 		 618 aa  90.1  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  28 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  25.45 
 
 		 619 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  25.43 
 
 		 842 aa  80.5  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.64 
 
 		 653 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.81 
 
 		 998 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  28.36 
 
 		 998 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  23.06 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  23.06 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  26.47 
 
 		 625 aa  77  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  27.74 
 
 		 582 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  29.61 
 
 		 655 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  27.51 
 
 		 613 aa  75.5  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  25.36 
 
 		 635 aa  75.5  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  25.91 
 
 		 577 aa  74.3  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  27.76 
 
 		 596 aa  74.3  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  29.17 
 
 		 655 aa  73.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  30.62 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  27.33 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.05 
 
 		 582 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.05 
 
 		 582 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  27.05 
 
 		 582 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  25 
 
 		 572 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  23.44 
 
 		 642 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  27.88 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  21.47 
 
 		 615 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  23.86 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  23.3 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  23.99 
 
 		 642 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  23.82 
 
 		 642 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  27.3 
 
 		 621 aa  67.8  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  23.82 
 
 		 642 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  27.44 
 
 		 615 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  27.99 
 
 		 617 aa  67.4  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  26.38 
 
 		 594 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  25.7 
 
 		 610 aa  67  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  22.09 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  26.38 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  22.05 
 
 		 608 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  23.7 
 
 		 642 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>