More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3723 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
369 aa  747    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298424  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  77.22 
 
 
1715 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  65.93 
 
 
1469 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28810  putative DNA helicase  53.19 
 
 
1707 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0849671  decreased coverage  0.0000000181114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.17 
 
 
1473 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0422166 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.44 
 
 
594 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.77 
 
 
647 aa  156  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.9 
 
 
717 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.36 
 
 
598 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.29 
 
 
653 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.255198  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0275  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.41 
 
 
642 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0919838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.56 
 
 
592 aa  150  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.99 
 
 
721 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.1 
 
 
592 aa  149  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.07 
 
 
724 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.7 
 
 
593 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.28 
 
 
737 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.82 
 
 
630 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.7 
 
 
593 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.53 
 
 
779 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  37.55 
 
 
608 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.36 
 
 
451 aa  146  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1322  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.42 
 
 
664 aa  146  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0577384  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0369  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.41 
 
 
642 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.84 
 
 
593 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.41 
 
 
649 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.99 
 
 
729 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.1 
 
 
716 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.91 
 
 
606 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09613  ATP-dependent DNA helicase recQ  32.89 
 
 
632 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 
705 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 
705 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.59 
 
 
605 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.35 
 
 
607 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 
705 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5409  ATP-dependent DNA helicase domain protein  41.92 
 
 
642 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274257  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.85 
 
 
626 aa  143  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  37.12 
 
 
608 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.39 
 
 
881 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 
706 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 
705 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 
705 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  41.03 
 
 
705 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  41.03 
 
 
705 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.03 
 
 
705 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.29 
 
 
731 aa  143  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.24 
 
 
705 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.24 
 
 
705 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 
615 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.7 
 
 
607 aa  142  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  37.21 
 
 
724 aa  142  7e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  40.53 
 
 
637 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3396  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  39.9 
 
 
636 aa  142  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119558  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  39.2 
 
 
698 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.6 
 
 
606 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.76 
 
 
509 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.5 
 
 
596 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.41 
 
 
602 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.68 
 
 
600 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.65 
 
 
736 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.56 
 
 
705 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.76 
 
 
509 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1366  ATP-dependent DNA helicase Q  37.76 
 
 
509 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000433489  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  35.68 
 
 
734 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.07 
 
 
612 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.03 
 
 
602 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.69 
 
 
725 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  37.16 
 
 
597 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.21 
 
 
714 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.76 
 
 
509 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1609  ATP-dependent DNA helicase  37.76 
 
 
184 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000276836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.09 
 
 
707 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3541  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.12 
 
 
644 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133366  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.5 
 
 
634 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.43 
 
 
685 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.44 
 
 
626 aa  140  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.5 
 
 
631 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.81 
 
 
790 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1895  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.75 
 
 
633 aa  139  7.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.32 
 
 
641 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1535  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.03 
 
 
596 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.2 
 
 
637 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03262  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.86 
 
 
641 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002717  aTP-dependent DNA helicase RecQ family  36.94 
 
 
641 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.82 
 
 
793 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.07 
 
 
601 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.39 
 
 
527 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.61 
 
 
615 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.41 
 
 
633 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4206  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.61 
 
 
628 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.08 
 
 
679 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  33.46 
 
 
493 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0888  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.39 
 
 
595 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.55 
 
 
707 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.22 
 
 
864 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.75 
 
 
642 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.38 
 
 
646 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.9 
 
 
634 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.73 
 
 
509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.34 
 
 
662 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>