More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3411 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3411  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397943  normal  0.632381 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3676  GntR family transcriptional regulator  98.76 
 
 		 241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0184  GntR family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 228 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0611  GntR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 242 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.600848  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.1 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  28.1 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  33.09 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  29.76 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  26.87 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  29.76 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1613  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1827  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000849458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  28.44 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  25.23 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1681  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1661  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1622  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 261 aa  62  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 235 aa  62  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 221 aa  62  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5798  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>