More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3093 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  80.48 
 
 		 214 aa  345  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 216 aa  281  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 252 aa  85.5  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  30.81 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6608  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0123942 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6375  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.405237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.67 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  35.05 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2389  putative transcriptional regulator  31.66 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  32.32 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6702  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.78486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 232 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 263 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>