289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2513 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  99.67 
 
 		 303 aa  610  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 303 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  93.73 
 
 		 303 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0054  ornithine cyclodeaminase  64.97 
 
 		 301 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  58.17 
 
 		 305 aa  341  8e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  50.51 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  44.78 
 
 		 313 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.67 
 
 		 312 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  42.12 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  41.15 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  43.97 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  38.21 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  42.05 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  40.77 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.47 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.68 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  35.88 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  35.89 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2747  ornithine cyclodeaminase  34.19 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  38.7 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  35.64 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  35.89 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  36.92 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  37.17 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  33.07 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  36.29 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3226  ornithine cyclodeaminase  35.5 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.674248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.83 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  36.4 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  32.68 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.82 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  32.95 
 
 		 325 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  32.2 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.28 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  32.08 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  37.07 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  37.76 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.73 
 
 		 325 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.82 
 
 		 325 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  31.66 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  32.79 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.06 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  32.33 
 
 		 325 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  34.69 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  32.66 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30.2 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  34.43 
 
 		 326 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  35.77 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  31.48 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  31.71 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.69 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.69 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  32.26 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  31.54 
 
 		 333 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  32.79 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  33.2 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.57 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  29.53 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 333 aa  102  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  34.19 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.11 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  32.52 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  32.77 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  32.92 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.97 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  31.99 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  32.43 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  30.49 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  33.6 
 
 		 329 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  35.48 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  29.06 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  33.2 
 
 		 330 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  29.02 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.33 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  31.15 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  28.92 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  28.16 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  29.83 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  30.33 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  32.1 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  32.8 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  26.85 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  30.08 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  32 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.17 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  29.39 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  30.86 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  31.1 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.94 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>