More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2929 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2929  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0877107  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1099  lipoprotein signal peptidase  82.8 
 
 		 185 aa  289  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2762  lipoprotein signal peptidase  82.8 
 
 		 185 aa  288  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  54.1 
 
 		 227 aa  194  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  56.69 
 
 		 158 aa  175  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  58.62 
 
 		 160 aa  157  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4043  signal peptidase II  46.79 
 
 		 157 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  35.52 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  41.88 
 
 		 160 aa  91.3  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 171 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 171 aa  89  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 171 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 164 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 173 aa  84.3  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  38.04 
 
 		 164 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  36.53 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  36.76 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  35.98 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3258  signal peptidase II  37.43 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.802617  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  33.82 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  35 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36.54 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  42.5 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  31.43 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  34.29 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  31.88 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  32.85 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  30.9 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  30.54 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  31.54 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  29.25 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  33.13 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1715  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  35.46 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  34.97 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  31.52 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  35.66 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  33.55 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  33.97 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  30.5 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  31.91 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  27.54 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  32.2 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  37.93 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  33.78 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  31.69 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  29.75 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>