More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2484 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  93.01 
 
 		 286 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  92.66 
 
 		 286 aa  547  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  76.57 
 
 		 286 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  75.17 
 
 		 286 aa  447  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  75.26 
 
 		 284 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  73.43 
 
 		 285 aa  414  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  60.92 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  62.46 
 
 		 284 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  63.07 
 
 		 284 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  59.93 
 
 		 285 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  59.58 
 
 		 285 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  57.5 
 
 		 286 aa  340  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  57.49 
 
 		 285 aa  337  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  58.06 
 
 		 286 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  57.35 
 
 		 286 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  55.36 
 
 		 286 aa  329  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  54.29 
 
 		 287 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  55 
 
 		 286 aa  324  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  57.35 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  58.21 
 
 		 282 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  55.04 
 
 		 285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  55.91 
 
 		 285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  53.5 
 
 		 293 aa  302  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  53.5 
 
 		 293 aa  302  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  58.57 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  55.2 
 
 		 285 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  53.68 
 
 		 288 aa  298  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  52.8 
 
 		 293 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  55.05 
 
 		 286 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  51.97 
 
 		 290 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  51.43 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  51.43 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  53.99 
 
 		 285 aa  265  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.59 
 
 		 285 aa  265  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  48.42 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  48.61 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  47.81 
 
 		 283 aa  258  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  45.04 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.97 
 
 		 288 aa  255  7e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  49.82 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  48.75 
 
 		 285 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  49.64 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  50.71 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  46.59 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  46.5 
 
 		 288 aa  242  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  41.28 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  46.45 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  47.35 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  43.77 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  46.69 
 
 		 301 aa  224  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  44.09 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  41.58 
 
 		 286 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  41.87 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  38.63 
 
 		 285 aa  215  5e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  41.87 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  40.28 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  42.2 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  40.21 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  41.03 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.72 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  37.73 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  37.73 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  40.29 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.64 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  37.37 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  37.73 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  39.79 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.29 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  35.51 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  36.4 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  39.42 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  36.13 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  38.18 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  38.18 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  38.18 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  38.41 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  37.82 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  38.04 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  38.04 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  37.82 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  37.82 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.46 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.87 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  36.62 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  35.25 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  36.07 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  34.31 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  37.09 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.48 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  36.16 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  33.21 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  33.21 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  36.3 
 
 		 288 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  33.21 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  33.58 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  33.96 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>