221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0761 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0761  radical SAM family protein  100 
 
 		 503 aa  1014    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.510153  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  22.82 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  32.14 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  33.88 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  33.06 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  33.06 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  33.06 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  33.06 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  33.06 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  33.06 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  33.06 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  33.06 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1043  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  30.97 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.19 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  20.11 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  20.11 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 355 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0454  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.62 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  21.38 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  28.69 
 
 		 343 aa  57  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0883  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.89 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1605  hypothetical protein  19.6 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  26.03 
 
 		 347 aa  55.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  33.07 
 
 		 382 aa  54.7  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0795  Radical SAM domain protein  38 
 
 		 296 aa  54.3  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  20.43 
 
 		 384 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.57 
 
 		 373 aa  54.3  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  20.87 
 
 		 329 aa  54.3  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.08 
 
 		 296 aa  53.9  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  23.34 
 
 		 355 aa  53.5  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.86 
 
 		 395 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 338 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.24 
 
 		 381 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.37 
 
 		 375 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  19.77 
 
 		 873 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.3 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 265 aa  51.6  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 		 377 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  28.87 
 
 		 292 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 		 330 aa  50.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  21.78 
 
 		 338 aa  50.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5689  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 		 416 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  18.9 
 
 		 344 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 427 aa  50.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  28.45 
 
 		 284 aa  50.4  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3305  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.12 
 
 		 370 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 437 aa  50.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41640  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.13 
 
 		 383 aa  50.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 391 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  27.27 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  31.71 
 
 		 335 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.12 
 
 		 414 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 406 aa  50.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 315 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  32.79 
 
 		 434 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 406 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.23 
 
 		 372 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  25.16 
 
 		 337 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.78 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 446 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.31 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.21 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  21.74 
 
 		 342 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0689  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.08 
 
 		 389 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.62446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.85 
 
 		 345 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.43 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  31.9 
 
 		 346 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 334 aa  49.3  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.43 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0257  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 315 aa  49.3  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.862128  normal  0.0494726 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 281 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 358 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.27 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.67 
 
 		 374 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0790  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.29 
 
 		 291 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.134726  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  32.54 
 
 		 362 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.85 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 319 aa  48.5  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>